99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4501 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 316 aa  663    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  42.17 
 
 		 450 aa  229  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.14 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  37.69 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  40.47 
 
 		 348 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.49 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  36.08 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  38.84 
 
 		 383 aa  188  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  38.82 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  38.51 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  37.54 
 
 		 367 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.43 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  35.94 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  38.2 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  37.24 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  36.42 
 
 		 1186 aa  175  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  35.33 
 
 		 535 aa  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  36.22 
 
 		 679 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  37.82 
 
 		 533 aa  169  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  36.13 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  35.11 
 
 		 509 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.83 
 
 		 330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  35.16 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  37.35 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.77 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  37.04 
 
 		 383 aa  163  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  37.58 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  35.37 
 
 		 464 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  35.67 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.74 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  35.43 
 
 		 618 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  32.93 
 
 		 524 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  34.87 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  31.96 
 
 		 404 aa  152  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  34.92 
 
 		 527 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  37.15 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  32.3 
 
 		 487 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  29.57 
 
 		 1338 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  32.9 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  28.04 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.12 
 
 		 712 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  31.52 
 
 		 644 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  28.75 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  29.04 
 
 		 323 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  30.18 
 
 		 667 aa  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.58 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  24.21 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  26.36 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.41 
 
 		 522 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  26.03 
 
 		 855 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.76 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  28.35 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  24.78 
 
 		 829 aa  59.3  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  27.05 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  23.41 
 
 		 524 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.03 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.74 
 
 		 536 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  27.49 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  25.62 
 
 		 551 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  26.41 
 
 		 517 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.16 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  26.82 
 
 		 543 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.75 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  26.72 
 
 		 550 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.57 
 
 		 560 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  27.23 
 
 		 512 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 		 504 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  28.63 
 
 		 357 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 		 506 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  31.17 
 
 		 341 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.8 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  26.7 
 
 		 501 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 		 563 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  21.15 
 
 		 572 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.61 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  28.46 
 
 		 519 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 636 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  27.1 
 
 		 472 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  25.87 
 
 		 525 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  24.39 
 
 		 522 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  23.92 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.18 
 
 		 810 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  23.47 
 
 		 522 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  24.75 
 
 		 522 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  33.04 
 
 		 699 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  27.07 
 
 		 713 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.68 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.52 
 
 		 538 aa  43.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  25.29 
 
 		 537 aa  43.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.79 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  25.38 
 
 		 501 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0697  beta-glucanase precursor  26.58 
 
 		 381 aa  43.1  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.79 
 
 		 577 aa  42.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.89 
 
 		 327 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>