More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0048 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0048  MATE efflux family protein  100 
 
 		 501 aa  1011    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.331446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27 
 
 		 468 aa  127  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 446 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 452 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  29.32 
 
 		 452 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  29.77 
 
 		 462 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 470 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  27.24 
 
 		 447 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 459 aa  98.6  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 447 aa  96.7  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 452 aa  96.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 500 aa  94  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 453 aa  90.5  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 456 aa  90.1  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 485 aa  90.1  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  22.3 
 
 		 445 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 450 aa  88.6  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 500 aa  87.8  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  21.13 
 
 		 475 aa  87.8  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 485 aa  87.8  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.1 
 
 		 469 aa  87.4  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  22.53 
 
 		 446 aa  86.7  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 486 aa  86.7  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  21.72 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  24.86 
 
 		 525 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  23.23 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 481 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  28 
 
 		 538 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  23 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  23.74 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  23.95 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  22.02 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  23.95 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  23.53 
 
 		 546 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  23.53 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  24.16 
 
 		 546 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  23.8 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 554 aa  77  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  23.01 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  23.68 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  23.13 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  22.19 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  22.8 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  22.8 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  22.92 
 
 		 518 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  23.22 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  23.57 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  23.2 
 
 		 454 aa  73.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  22.37 
 
 		 464 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  22.33 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  22.7 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  22.11 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  23.25 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  23.39 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  21.12 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 454 aa  69.7  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  23.13 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  22.95 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  21.2 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  24.64 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  21.97 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2173  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.843006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 434 aa  67  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>