77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1959 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1959  SMC domain protein  100 
 
 		 930 aa  1842    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.726371  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4769  SMC domain-containing protein  43.8 
 
 		 944 aa  623  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3475  SMC domain protein  42.62 
 
 		 944 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.508672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4117  SMC domain-containing protein  42.24 
 
 		 944 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2543  hypothetical protein  41.24 
 
 		 936 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2446  hypothetical protein  39.37 
 
 		 778 aa  439  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.4 
 
 		 1171 aa  68.6  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  22.46 
 
 		 1175 aa  65.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  21.08 
 
 		 1174 aa  62  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  21.41 
 
 		 1240 aa  56.6  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  23.65 
 
 		 1196 aa  55.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  27.02 
 
 		 1150 aa  54.7  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  45 
 
 		 1195 aa  53.9  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  24.17 
 
 		 1193 aa  53.5  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.07 
 
 		 1170 aa  53.5  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  46.67 
 
 		 1198 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.19 
 
 		 1170 aa  52  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  45 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  24.51 
 
 		 1476 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  26.05 
 
 		 1174 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  26.05 
 
 		 1174 aa  50.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  26.05 
 
 		 1204 aa  49.3  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 		 1185 aa  49.3  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  29.71 
 
 		 1194 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  26.94 
 
 		 1199 aa  49.7  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  38.33 
 
 		 1202 aa  49.7  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  29.52 
 
 		 1185 aa  48.9  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.71 
 
 		 1191 aa  48.9  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  22.41 
 
 		 1192 aa  48.9  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  29.71 
 
 		 1190 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  31.58 
 
 		 1189 aa  48.9  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  22.08 
 
 		 1146 aa  48.9  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1146 aa  48.5  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  38.36 
 
 		 1174 aa  48.5  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1226 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  39.73 
 
 		 1147 aa  47  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  25.23 
 
 		 1167 aa  47.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  24.08 
 
 		 1200 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  25.58 
 
 		 1175 aa  47.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  25.58 
 
 		 1182 aa  47.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1226 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  40 
 
 		 1208 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  36.67 
 
 		 1201 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  23.72 
 
 		 1170 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  25.58 
 
 		 1185 aa  47  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  31.82 
 
 		 1153 aa  46.6  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  36.67 
 
 		 1204 aa  46.6  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  29.13 
 
 		 1190 aa  47  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  24.93 
 
 		 1175 aa  47  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  29.82 
 
 		 1196 aa  46.2  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  23.72 
 
 		 1151 aa  46.2  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  28.57 
 
 		 1178 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  25.49 
 
 		 1186 aa  46.2  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  25.12 
 
 		 1175 aa  46.2  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.82 
 
 		 1190 aa  46.2  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  22.87 
 
 		 1225 aa  46.2  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  41.3 
 
 		 1082 aa  45.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.62 
 
 		 1186 aa  45.8  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  29.13 
 
 		 1179 aa  45.8  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1217 aa  45.8  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  26.24 
 
 		 1203 aa  45.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  38.36 
 
 		 1140 aa  45.4  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  26.61 
 
 		 1176 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  23.32 
 
 		 1170 aa  45.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  25.11 
 
 		 1181 aa  45.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  37.29 
 
 		 1147 aa  45.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  25.25 
 
 		 1074 aa  45.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  35.59 
 
 		 1146 aa  45.1  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  23.48 
 
 		 1188 aa  44.7  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  26.4 
 
 		 1188 aa  44.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  35 
 
 		 1207 aa  44.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  23.37 
 
 		 1175 aa  44.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  25.42 
 
 		 1145 aa  44.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  25.68 
 
 		 1152 aa  44.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  25.68 
 
 		 1152 aa  44.7  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  33.62 
 
 		 1194 aa  44.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 		 1224 aa  44.3  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>