64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2543 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2446  hypothetical protein  99.74 
 
 		 778 aa  1547    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2543  hypothetical protein  100 
 
 		 936 aa  1885    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4117  SMC domain-containing protein  57.55 
 
 		 944 aa  991    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4769  SMC domain-containing protein  57.55 
 
 		 944 aa  986    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3475  SMC domain protein  57.34 
 
 		 944 aa  989    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.508672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1959  SMC domain protein  41.44 
 
 		 930 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.726371  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  24.43 
 
 		 1178 aa  55.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  26.86 
 
 		 1190 aa  55.1  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  42.86 
 
 		 1219 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  25.3 
 
 		 1179 aa  51.2  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.41 
 
 		 1186 aa  50.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.07 
 
 		 1177 aa  50.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  24.37 
 
 		 1165 aa  50.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  28.32 
 
 		 1225 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  26.12 
 
 		 1174 aa  49.3  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  21.91 
 
 		 1175 aa  49.7  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  26.12 
 
 		 1174 aa  49.7  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.02 
 
 		 1178 aa  49.3  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  25.09 
 
 		 1169 aa  49.3  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  25.17 
 
 		 1175 aa  48.9  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  39.29 
 
 		 1208 aa  48.9  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1226 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1226 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  25.31 
 
 		 1171 aa  47.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  25.71 
 
 		 1171 aa  47.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  25.59 
 
 		 1133 aa  47.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  24.2 
 
 		 299 aa  47.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  37.5 
 
 		 1202 aa  47  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  24.72 
 
 		 1169 aa  47  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  39.29 
 
 		 1198 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  44.44 
 
 		 978 aa  47  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  25.44 
 
 		 1185 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  25.7 
 
 		 1140 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  35.71 
 
 		 1207 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  42.86 
 
 		 1190 aa  46.2  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  38 
 
 		 1082 aa  46.2  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  24.69 
 
 		 1164 aa  46.2  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1214 aa  46.2  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  39.29 
 
 		 1195 aa  46.2  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  30.77 
 
 		 1190 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1217 aa  45.8  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  25.31 
 
 		 1204 aa  45.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  23.46 
 
 		 1191 aa  45.4  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  26.37 
 
 		 1199 aa  45.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  28.3 
 
 		 1174 aa  45.4  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  24.54 
 
 		 1163 aa  45.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  30.51 
 
 		 1189 aa  45.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  25.31 
 
 		 1175 aa  45.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  50 
 
 		 1174 aa  45.4  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  25.51 
 
 		 1182 aa  45.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  34.69 
 
 		 1165 aa  45.4  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  33.93 
 
 		 1196 aa  45.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  24.49 
 
 		 1141 aa  45.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  36.73 
 
 		 1196 aa  45.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  35.71 
 
 		 1201 aa  45.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  35.71 
 
 		 1194 aa  44.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  35.23 
 
 		 1153 aa  44.7  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  33.93 
 
 		 1196 aa  44.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1118 aa  44.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1120 aa  44.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1120 aa  44.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  38.18 
 
 		 1194 aa  44.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  33.93 
 
 		 1196 aa  44.3  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  24.6 
 
 		 1261 aa  44.3  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>