38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4769 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2446  hypothetical protein  54.36 
 
 		 778 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3475  SMC domain protein  86.12 
 
 		 944 aa  1624    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.508672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4117  SMC domain-containing protein  86.02 
 
 		 944 aa  1619    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2543  hypothetical protein  57.55 
 
 		 936 aa  991    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4769  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 944 aa  1890    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959712 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1959  SMC domain protein  43.35 
 
 		 930 aa  619  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.726371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  32.56 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  22.04 
 
 		 1191 aa  49.7  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  24.02 
 
 		 1109 aa  48.9  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  39.34 
 
 		 1174 aa  48.9  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  42.59 
 
 		 1198 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  40 
 
 		 1082 aa  48.5  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  37.04 
 
 		 1226 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  37.04 
 
 		 1226 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  32.08 
 
 		 1174 aa  48.1  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  38.89 
 
 		 1195 aa  47.8  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  37.04 
 
 		 1208 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  38.89 
 
 		 1190 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  33.96 
 
 		 1175 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  23.43 
 
 		 1164 aa  47.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  35.19 
 
 		 1202 aa  46.6  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  33.72 
 
 		 906 aa  47  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  21.45 
 
 		 1164 aa  46.6  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  35.19 
 
 		 1201 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  40.82 
 
 		 1190 aa  45.8  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  22.63 
 
 		 1164 aa  45.4  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1123 aa  45.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  23.74 
 
 		 1171 aa  45.4  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  37.04 
 
 		 1217 aa  45.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  38.78 
 
 		 1190 aa  45.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  19.41 
 
 		 1174 aa  45.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  29.52 
 
 		 1189 aa  45.1  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  38.78 
 
 		 1179 aa  45.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  36.49 
 
 		 1202 aa  45.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  27.88 
 
 		 1189 aa  44.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  28.34 
 
 		 1200 aa  44.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  38.78 
 
 		 1196 aa  44.3  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  23.05 
 
 		 1165 aa  44.7  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>