61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3475 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4769  SMC domain-containing protein  86.12 
 
 		 944 aa  1600    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4117  SMC domain-containing protein  98.62 
 
 		 944 aa  1876    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2446  hypothetical protein  53.72 
 
 		 778 aa  745    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3475  SMC domain protein  100 
 
 		 944 aa  1897    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.508672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2543  hypothetical protein  57.34 
 
 		 936 aa  980    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1959  SMC domain protein  42.13 
 
 		 930 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.726371  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  22.22 
 
 		 1174 aa  55.1  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  19.88 
 
 		 1113 aa  53.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  24.44 
 
 		 1177 aa  52  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  22.45 
 
 		 1191 aa  51.6  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  31.4 
 
 		 1219 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  24.11 
 
 		 1162 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  24.14 
 
 		 1164 aa  50.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  21.99 
 
 		 1164 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.25 
 
 		 1186 aa  50.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  24.03 
 
 		 1162 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  21.29 
 
 		 1109 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  29.09 
 
 		 1189 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.02 
 
 		 1164 aa  49.3  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  34.88 
 
 		 906 aa  49.3  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  38.89 
 
 		 1226 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  38.89 
 
 		 1226 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  32.08 
 
 		 1174 aa  48.5  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  33.96 
 
 		 1175 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  40.74 
 
 		 1195 aa  48.9  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  22.78 
 
 		 1165 aa  48.5  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  39.34 
 
 		 1174 aa  48.1  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  40 
 
 		 1082 aa  48.1  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  38.89 
 
 		 1208 aa  48.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  40.74 
 
 		 1190 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  22.81 
 
 		 1149 aa  48.1  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  21.67 
 
 		 1170 aa  47.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  21.69 
 
 		 1162 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  40.74 
 
 		 1198 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  22.03 
 
 		 1162 aa  46.6  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  25.66 
 
 		 1178 aa  46.6  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  22.83 
 
 		 1189 aa  47  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  47.22 
 
 		 978 aa  46.6  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  40.82 
 
 		 1190 aa  46.6  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  37.04 
 
 		 1201 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  35.19 
 
 		 1202 aa  47  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1123 aa  47  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  38.89 
 
 		 1217 aa  45.8  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  25.66 
 
 		 1179 aa  46.2  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  22.58 
 
 		 1204 aa  45.8  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  26.54 
 
 		 1167 aa  45.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.75 
 
 		 1171 aa  45.4  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1121 aa  45.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  21.36 
 
 		 1162 aa  45.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  23.76 
 
 		 1162 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1122 aa  45.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  34.78 
 
 		 1133 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  23.4 
 
 		 1162 aa  45.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  41.43 
 
 		 1140 aa  44.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  39.58 
 
 		 423 aa  44.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  38.78 
 
 		 1190 aa  44.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  38.78 
 
 		 1196 aa  44.7  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  25.84 
 
 		 1207 aa  44.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  21.93 
 
 		 1163 aa  44.3  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1125 aa  44.3  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  28.38 
 
 		 558 aa  44.3  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>