More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08290 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  100 
 
 		 367 aa  704    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  40.27 
 
 		 381 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  40.27 
 
 		 381 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  40 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  38.02 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  39.82 
 
 		 384 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  39.29 
 
 		 457 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  40.52 
 
 		 423 aa  192  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  43.87 
 
 		 420 aa  189  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  39.94 
 
 		 487 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  37.65 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  38.2 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  39.04 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  40.75 
 
 		 455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  39.18 
 
 		 439 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  41.97 
 
 		 475 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  38.46 
 
 		 402 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  36.13 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  33.81 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  38.83 
 
 		 483 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  34.86 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  39.29 
 
 		 421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  37.85 
 
 		 452 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  34.77 
 
 		 426 aa  155  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  37.2 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  37.79 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  38.26 
 
 		 384 aa  152  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  36.12 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  36 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  37.79 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  38.51 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  34.25 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  37.13 
 
 		 423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  40.68 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  32.71 
 
 		 435 aa  145  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  31.93 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  38.05 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  36 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  32.97 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  32.61 
 
 		 477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  34.6 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  34.6 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  38.75 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  35.76 
 
 		 436 aa  136  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  34.05 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  35.33 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  33.76 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  30.75 
 
 		 407 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  30.06 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  34.47 
 
 		 355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  35.48 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.29 
 
 		 455 aa  106  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  33.89 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  31.75 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  27.2 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  27.38 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.54 
 
 		 390 aa  92.8  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  23.15 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  30.58 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 369 aa  87  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  31.93 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.51 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  26.72 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.94 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  28.65 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.03 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  29.53 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  26.36 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.34 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  29.52 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  28.71 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.11 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.74 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.85 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.11 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  25.72 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  26.8 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  25.41 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  26.33 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  26.8 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  25.98 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.69 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  26.47 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  29.88 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  25.41 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  24.22 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  22.42 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.86 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  26.47 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  26.47 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  26.47 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  25.41 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  28.7 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  26.47 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  26.47 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  27.88 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  26.47 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  27.8 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>