More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0238 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  822    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  45.45 
 
 		 487 aa  335  9e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  50.42 
 
 		 423 aa  323  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  44.67 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  45.75 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  45.75 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  45.75 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  44.69 
 
 		 384 aa  269  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  44.75 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  50.14 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  44.35 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  42.07 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  43.06 
 
 		 367 aa  243  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  41.81 
 
 		 464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  44.26 
 
 		 420 aa  237  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  42.21 
 
 		 439 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  40.46 
 
 		 455 aa  229  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  43.26 
 
 		 421 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  48.82 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  45.28 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  41.84 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  43.9 
 
 		 396 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  37.54 
 
 		 477 aa  209  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  41.28 
 
 		 483 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  35.26 
 
 		 436 aa  206  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  41.93 
 
 		 405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  38.54 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  36.53 
 
 		 407 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  33.23 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  40.75 
 
 		 387 aa  176  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  34.66 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  36.13 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  34.77 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  39.06 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  37.87 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  32.47 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  33.81 
 
 		 367 aa  170  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  34.75 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  31.69 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  31.12 
 
 		 426 aa  155  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  35.45 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  37.85 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  35.87 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  32.76 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  34.92 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  33.71 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  31.88 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  34.54 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  34.54 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  35.71 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  34.69 
 
 		 432 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  33.09 
 
 		 476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  31.02 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  33.85 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  29.68 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.76 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  28.16 
 
 		 563 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.79 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.79 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.08 
 
 		 405 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  29.41 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.84 
 
 		 354 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  26.85 
 
 		 388 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.7 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  25.53 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  29.35 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  25.16 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.71 
 
 		 361 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.71 
 
 		 361 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  27.71 
 
 		 362 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  26.32 
 
 		 368 aa  90.1  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  29.13 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  26.58 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  23.46 
 
 		 526 aa  89.4  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.98 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  22.12 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.71 
 
 		 361 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.04 
 
 		 344 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.71 
 
 		 361 aa  87.8  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.71 
 
 		 361 aa  87.8  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.68 
 
 		 348 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.93 
 
 		 361 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  25.89 
 
 		 329 aa  87  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  27.1 
 
 		 370 aa  86.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  26.1 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.71 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  27.18 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.93 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  25.67 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  26.89 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  26.57 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  28.74 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  24.55 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  21.81 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  25.3 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  25.77 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  24.79 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  25.69 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>