More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2050 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  723    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  70.68 
 
 		 370 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  56.7 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  33.75 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  32.65 
 
 		 329 aa  169  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  34.52 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  33.23 
 
 		 363 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  35.52 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  32.4 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  30.99 
 
 		 378 aa  159  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  34.58 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  33.84 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  32.46 
 
 		 357 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  34.38 
 
 		 370 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  34.38 
 
 		 370 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  32.37 
 
 		 418 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  32.34 
 
 		 361 aa  156  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  33.83 
 
 		 356 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  33.53 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  33.83 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  32.37 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  32.37 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  32.37 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  32.22 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  31.76 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  28.9 
 
 		 351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  33.43 
 
 		 360 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  32.94 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  32.96 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  31.69 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  31.4 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  30.7 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  32 
 
 		 347 aa  150  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  32 
 
 		 347 aa  150  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  33.24 
 
 		 356 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  31.12 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  34.18 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  30.19 
 
 		 665 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  33.33 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  30.72 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  30.42 
 
 		 379 aa  145  8.000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  34.15 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  31.14 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  31.79 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  29.18 
 
 		 367 aa  142  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  29.18 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  31.79 
 
 		 345 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  31.62 
 
 		 547 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  28.23 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  30.66 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  32.63 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  31.69 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  28.02 
 
 		 396 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  30.93 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  29.15 
 
 		 368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  30.17 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  31.44 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.75 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  29.31 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  29.31 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  29.84 
 
 		 436 aa  133  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  29.61 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.83 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  31.07 
 
 		 415 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  30.56 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  30.92 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  30.51 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  31.32 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  30.35 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  30.15 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  30.35 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  32.15 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  31.92 
 
 		 364 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  29.04 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  30.24 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  30.24 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  31.67 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  29.64 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  30.24 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  30.06 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  29.04 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  29.64 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  28.98 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  32.66 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  30.09 
 
 		 434 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  29.64 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  29.34 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  28.69 
 
 		 373 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  29.34 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  29.79 
 
 		 373 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  29.26 
 
 		 373 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  28.74 
 
 		 361 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  29.01 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.98 
 
 		 354 aa  123  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  30.41 
 
 		 375 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  28.69 
 
 		 373 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  28.69 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  28.69 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  28.69 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>