More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0938 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 420 aa  801    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  59.9 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  58.67 
 
 		 421 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  60.96 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  50.44 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  45.63 
 
 		 477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  50.59 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  51.43 
 
 		 439 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  44.76 
 
 		 383 aa  273  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  45.75 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  45.75 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  45.75 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  45.43 
 
 		 487 aa  263  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  43.8 
 
 		 464 aa  262  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  46.82 
 
 		 423 aa  262  8.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  44.13 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  46.73 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  44.26 
 
 		 421 aa  249  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  43.66 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  50.15 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  49.11 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  46.71 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  41.5 
 
 		 402 aa  226  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  41.48 
 
 		 367 aa  224  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  41.71 
 
 		 405 aa  223  7e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  42.82 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  38.27 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  36.39 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  37.4 
 
 		 397 aa  186  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  41.38 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  37.76 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  36.87 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  38.86 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  35.69 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  37.26 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  37.98 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  39.94 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  34.83 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  36.06 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  38.79 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  38.99 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  41.32 
 
 		 390 aa  159  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  38.8 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  38.8 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  35.63 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  33.8 
 
 		 476 aa  149  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  41.61 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  35.48 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  37.34 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  30.7 
 
 		 435 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  36.22 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  35.24 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  37.59 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  30.7 
 
 		 529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.07 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.07 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  36.25 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  27.36 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  26.48 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  29.22 
 
 		 354 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  24.19 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.47 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  27.3 
 
 		 384 aa  98.2  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.52 
 
 		 354 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  29.78 
 
 		 429 aa  96.7  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  26.63 
 
 		 358 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  31.34 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  29.53 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.21 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  28.66 
 
 		 356 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  30.12 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  30.72 
 
 		 369 aa  90.1  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  26.77 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  26.91 
 
 		 358 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  30.08 
 
 		 357 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  26.68 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  28.27 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  24.75 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  26.07 
 
 		 368 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.14 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  26.76 
 
 		 649 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  27.01 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  25.83 
 
 		 652 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  26.03 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.93 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  30.29 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  26.32 
 
 		 652 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  29.03 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  28.35 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.58 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.48 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.48 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.48 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.8 
 
 		 361 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.48 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  29.6 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.8 
 
 		 361 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.56 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  26.4 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>