More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2006 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  711    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  54.34 
 
 		 356 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  54.21 
 
 		 356 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  51.5 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  50.7 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  49.58 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  52.37 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  51.9 
 
 		 359 aa  352  4e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  47.91 
 
 		 350 aa  323  3e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  46.96 
 
 		 357 aa  319  5e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  50.28 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  50.43 
 
 		 356 aa  315  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  48.06 
 
 		 354 aa  310  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  46.69 
 
 		 356 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  49.16 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  49.72 
 
 		 357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  47.37 
 
 		 354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  45.96 
 
 		 355 aa  302  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.93 
 
 		 356 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  45.83 
 
 		 363 aa  302  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  48.41 
 
 		 356 aa  299  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  46.97 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  46.69 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  44.41 
 
 		 369 aa  289  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  43.77 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  43.77 
 
 		 357 aa  286  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  46.89 
 
 		 356 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  43.26 
 
 		 356 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  46.61 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  46.61 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  45.09 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  42.9 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  43.19 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  43.19 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  42.9 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  43.19 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  43.19 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  43.19 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  43.19 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  43.19 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  44.69 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  43.19 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  43.19 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  42.9 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  42.53 
 
 		 366 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  42.9 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  45.63 
 
 		 366 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  42.9 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  44.38 
 
 		 360 aa  276  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  42.9 
 
 		 355 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  44.79 
 
 		 358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  44.66 
 
 		 366 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  44.93 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  45.63 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  44.64 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  44.64 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  44.64 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  45.08 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  42.7 
 
 		 360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  48.13 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  46 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  46 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  46 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  46 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  44.29 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  42.74 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  42.7 
 
 		 361 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  42.62 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  43.55 
 
 		 363 aa  225  8e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  43.55 
 
 		 363 aa  225  8e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  33.24 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.43 
 
 		 351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  25.46 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  25.63 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  26.99 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.29 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  29.31 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  28.32 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.24 
 
 		 363 aa  116  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  27.08 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.43 
 
 		 343 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  30.11 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  30.11 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  29.06 
 
 		 357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.82 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  28.04 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  28.73 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  28.53 
 
 		 665 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.27 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  27.01 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  28.53 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  28.57 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  28.89 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  26.71 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  28.57 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  26.59 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  26.28 
 
 		 358 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  29.12 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  30.11 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>