More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1003 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1003  permease  100 
 
 		 350 aa  686    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  56.98 
 
 		 353 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  56.98 
 
 		 353 aa  408  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  56.98 
 
 		 353 aa  408  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  56.98 
 
 		 353 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  56.98 
 
 		 353 aa  408  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  56.98 
 
 		 353 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  56.98 
 
 		 353 aa  408  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  56.98 
 
 		 353 aa  408  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  56.98 
 
 		 353 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  56.86 
 
 		 357 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  58.86 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  56 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  56 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  56 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  56 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  56 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  58 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  57.71 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  56.61 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  56.03 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  56.03 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  56.03 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  56.73 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  51.43 
 
 		 361 aa  342  7e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  48.85 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  48.57 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  49.43 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  50.86 
 
 		 357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  51.42 
 
 		 369 aa  326  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  47.55 
 
 		 356 aa  325  6e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  49.86 
 
 		 356 aa  324  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  47.91 
 
 		 363 aa  323  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  49.14 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  51.27 
 
 		 366 aa  318  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  46.24 
 
 		 365 aa  318  7e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  47.28 
 
 		 359 aa  317  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  52.11 
 
 		 372 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  51.55 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  51.27 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  51.27 
 
 		 366 aa  309  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  51.12 
 
 		 360 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  51.83 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  50.14 
 
 		 360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  50.7 
 
 		 361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  50.14 
 
 		 360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  50.14 
 
 		 360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  50.14 
 
 		 360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  49.01 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  46.55 
 
 		 356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  46 
 
 		 353 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  51.27 
 
 		 360 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  49.71 
 
 		 356 aa  299  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  52.41 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  49 
 
 		 357 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  49 
 
 		 357 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  45.51 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  48.57 
 
 		 356 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  49.29 
 
 		 356 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  49.57 
 
 		 356 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.44 
 
 		 356 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  45.09 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  49.14 
 
 		 356 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  49.14 
 
 		 356 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  42 
 
 		 358 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  48.86 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  41.38 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  49.14 
 
 		 356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  44 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  44 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  34.12 
 
 		 362 aa  192  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 		 351 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.96 
 
 		 355 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.96 
 
 		 355 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.75 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.66 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.75 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.21 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  27.59 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  26.26 
 
 		 405 aa  123  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.65 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.65 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.65 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.65 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.65 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  30 
 
 		 348 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  27.33 
 
 		 393 aa  123  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  30.55 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  29.06 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  30.25 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  27.16 
 
 		 357 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  27.59 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.52 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  30.22 
 
 		 357 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.33 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  31.11 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  27.27 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  26.58 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  25.65 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  25.65 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>