More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02140 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02140  putative permease  100 
 
 		 357 aa  704    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  69.16 
 
 		 356 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  56.45 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  52.94 
 
 		 357 aa  374  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  55.59 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  54.34 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  52.09 
 
 		 361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  51.4 
 
 		 369 aa  354  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  52.68 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  50.57 
 
 		 355 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  50.57 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  50.57 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  50.57 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  50.57 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  49.43 
 
 		 350 aa  346  4e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  50 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  50 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  50 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  50 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  50 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  50 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  50 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  50 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  50 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  50.57 
 
 		 356 aa  338  5.9999999999999996e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  50 
 
 		 358 aa  338  7e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  51.7 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  52.41 
 
 		 360 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  53.31 
 
 		 372 aa  332  6e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  49.3 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  49.3 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  49.3 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  51.38 
 
 		 366 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  51 
 
 		 353 aa  328  8e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  50.83 
 
 		 366 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  50.99 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  50.55 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  50.55 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  50.7 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  50.7 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  50.7 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  50.7 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  46.44 
 
 		 356 aa  322  5e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  50.14 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  47.13 
 
 		 372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  52.27 
 
 		 361 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  48.39 
 
 		 359 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  49.31 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  47.31 
 
 		 353 aa  309  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.41 
 
 		 356 aa  305  6e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  43.66 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  42.9 
 
 		 363 aa  292  5e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  46.55 
 
 		 363 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  45.72 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  45.8 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  47.74 
 
 		 356 aa  279  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  47.89 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  47.37 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  48.31 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  48.02 
 
 		 357 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  48.02 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  45.54 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  47.74 
 
 		 356 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  46.33 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  46.33 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  46.33 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  40.41 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  46.61 
 
 		 356 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  46.31 
 
 		 363 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  46.31 
 
 		 363 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  37.87 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  32.22 
 
 		 344 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  29.07 
 
 		 396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  28.71 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  29.64 
 
 		 348 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.06 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  28.52 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  27.57 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  29.26 
 
 		 357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.7 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  30.1 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  28.74 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.89 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.37 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.39 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  29.91 
 
 		 390 aa  123  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  26.45 
 
 		 358 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  26.45 
 
 		 375 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  28.33 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.61 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  31.07 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  29.97 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  29.31 
 
 		 357 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2773  hypothetical protein  27.19 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28.21 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  28.74 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.71 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  27.95 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  28.2 
 
 		 374 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  26.37 
 
 		 357 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>