More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2087 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  699    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  52.15 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  50.14 
 
 		 363 aa  325  8.000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  47.21 
 
 		 358 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  47.03 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  50.14 
 
 		 357 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  49.58 
 
 		 357 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  50.43 
 
 		 356 aa  315  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  46 
 
 		 350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  45.85 
 
 		 362 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  45.85 
 
 		 362 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  45.85 
 
 		 355 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  45.85 
 
 		 362 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  46.76 
 
 		 355 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  49.29 
 
 		 358 aa  311  7.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  49.16 
 
 		 356 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  45.56 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  45.56 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  45.56 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  45.56 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  45.56 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  45.56 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  45.56 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  45.56 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  45.56 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  45.58 
 
 		 372 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  49.57 
 
 		 356 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  49.86 
 
 		 356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  47.43 
 
 		 361 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  50.72 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  50.72 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  48.38 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  48.38 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  48.38 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  45.66 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.4 
 
 		 356 aa  301  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  46.18 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  50.43 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  46.9 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  47.31 
 
 		 357 aa  299  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  45.64 
 
 		 356 aa  295  6e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  43.77 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  46.59 
 
 		 354 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  44.57 
 
 		 355 aa  292  6e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  43.71 
 
 		 365 aa  292  7e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  42.61 
 
 		 356 aa  291  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  45.82 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  43.87 
 
 		 369 aa  289  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  44.38 
 
 		 353 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  45.79 
 
 		 360 aa  276  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  51.86 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  42.31 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  44.26 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  41.18 
 
 		 366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  44.35 
 
 		 366 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  44.07 
 
 		 366 aa  266  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  43.79 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  43.79 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  43.38 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  45.13 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  42.94 
 
 		 360 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  42.94 
 
 		 360 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  42.94 
 
 		 360 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  42.94 
 
 		 360 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  41.81 
 
 		 372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  41.76 
 
 		 361 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  44.19 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  43.02 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  42.48 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  42.48 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  32.65 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  31.18 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.98 
 
 		 374 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  29.17 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  30.13 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  29.81 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  30.13 
 
 		 354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  30.25 
 
 		 357 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  28.96 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  29.17 
 
 		 357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  28.53 
 
 		 357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.71 
 
 		 343 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.45 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  28.85 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.9 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.95 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  28.11 
 
 		 357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  29.64 
 
 		 348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.76 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.68 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  27.01 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  28.52 
 
 		 370 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  28.52 
 
 		 370 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.76 
 
 		 398 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  27.02 
 
 		 379 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.68 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.68 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  28.52 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  28.26 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.44 
 
 		 354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>