More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1240 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  697    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  100 
 
 		 354 aa  697    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  100 
 
 		 354 aa  697    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  82.77 
 
 		 356 aa  583  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  77.4 
 
 		 362 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  77.4 
 
 		 355 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  77.4 
 
 		 355 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  77.4 
 
 		 362 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  77.12 
 
 		 362 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  78.1 
 
 		 353 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  78.1 
 
 		 353 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  78.1 
 
 		 353 aa  555  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  78.1 
 
 		 353 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  78.1 
 
 		 353 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  78.1 
 
 		 353 aa  555  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  78.1 
 
 		 353 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  78.1 
 
 		 353 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  78.1 
 
 		 353 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  76.95 
 
 		 353 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  57.79 
 
 		 357 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  58.38 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  56.03 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  58.79 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  57.58 
 
 		 356 aa  391  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  50.98 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  53.6 
 
 		 361 aa  362  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  53.82 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  52.42 
 
 		 366 aa  352  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  50.42 
 
 		 372 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  51.83 
 
 		 356 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  50.14 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  50.14 
 
 		 366 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  49.86 
 
 		 366 aa  338  8e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  50.28 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  50.28 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  50.28 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  50.28 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  50.56 
 
 		 361 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  49.86 
 
 		 360 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  50.7 
 
 		 366 aa  332  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  48.45 
 
 		 358 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  51.28 
 
 		 361 aa  329  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  49.3 
 
 		 357 aa  328  7e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  49.86 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  45.89 
 
 		 356 aa  319  5e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  48.99 
 
 		 357 aa  316  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  49.57 
 
 		 372 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  48.38 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.46 
 
 		 356 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  48.44 
 
 		 357 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  42.94 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  46.4 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  48.56 
 
 		 357 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  44.64 
 
 		 363 aa  296  4e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  43.64 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  48.13 
 
 		 356 aa  289  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  46.84 
 
 		 363 aa  285  9e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  48.28 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  44.6 
 
 		 356 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  47.41 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  47.41 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  42.74 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  47.7 
 
 		 356 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  47.7 
 
 		 356 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  44.64 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  47.41 
 
 		 356 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  48.28 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  41.45 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  44.35 
 
 		 363 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  44.35 
 
 		 363 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  36.84 
 
 		 362 aa  199  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.27 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  31.82 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.19 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  27.51 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.88 
 
 		 396 aa  126  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  29.06 
 
 		 357 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.96 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  29.28 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.73 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  29.88 
 
 		 357 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.86 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  28.75 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  29.1 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  28.53 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  29.88 
 
 		 379 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  27.08 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.46 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  30.19 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.81 
 
 		 361 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  26.55 
 
 		 348 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  27.96 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  29.6 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  26.5 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  26.5 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  26.5 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.5 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  27.53 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.18 
 
 		 373 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  25.4 
 
 		 344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>