More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1990 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 372 aa  727    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  71.35 
 
 		 358 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  57.02 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  57.26 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  51.5 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  54.29 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  54.62 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  53.01 
 
 		 356 aa  358  8e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  50.85 
 
 		 357 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  48.57 
 
 		 350 aa  339  4e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  50 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  53.01 
 
 		 356 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  52 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  49.44 
 
 		 356 aa  332  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.43 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  52.87 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  49.86 
 
 		 356 aa  324  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  48.75 
 
 		 363 aa  322  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  47.11 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  47.11 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  47.11 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  47.11 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  47.11 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  47.11 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  47.11 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  47.11 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  47.11 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  45.61 
 
 		 355 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  45.61 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  45.61 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  51.3 
 
 		 357 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  50.72 
 
 		 356 aa  315  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  45.61 
 
 		 355 aa  315  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  46.24 
 
 		 362 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  49.72 
 
 		 358 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  51.3 
 
 		 357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  46.65 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  46.22 
 
 		 354 aa  309  5e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  49.28 
 
 		 356 aa  308  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  47.08 
 
 		 361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  43.67 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  49.86 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  47.13 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  45.58 
 
 		 353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  49.57 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  49.57 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  49.57 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  43.87 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  43.88 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  46.02 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  45.1 
 
 		 360 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  44.67 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  49 
 
 		 356 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  49 
 
 		 356 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  44.92 
 
 		 366 aa  288  9e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  44.99 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  49 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  44.92 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  44.63 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  44.17 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  43.29 
 
 		 360 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  43.97 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  43.5 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  43.5 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  43.5 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  43.5 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  42.47 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  49.86 
 
 		 356 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  46.88 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  46.88 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  34.82 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  29.71 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  30.19 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  25.86 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  29.34 
 
 		 374 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  29.3 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  29.64 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  28.83 
 
 		 378 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  29.87 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.77 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.71 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  29.14 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.77 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.77 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.77 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.77 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.77 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.28 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.31 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.31 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  29.25 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  28.93 
 
 		 382 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  28.53 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  28.53 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  28.35 
 
 		 665 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  25.63 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  27.22 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.77 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2773  hypothetical protein  26.2 
 
 		 350 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>