More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1545 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  96.91 
 
 		 356 aa  620  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  86.24 
 
 		 356 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  83.43 
 
 		 356 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  83.43 
 
 		 356 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  83.43 
 
 		 356 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  78.63 
 
 		 356 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  82.87 
 
 		 356 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  74.07 
 
 		 357 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  73.3 
 
 		 357 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.39 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  52.01 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  56.34 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  52.3 
 
 		 356 aa  349  4e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  54.78 
 
 		 363 aa  345  8.999999999999999e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  50.71 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  54.78 
 
 		 359 aa  340  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  49.28 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  51.59 
 
 		 356 aa  333  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  49.86 
 
 		 353 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  52.84 
 
 		 354 aa  328  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  50.99 
 
 		 356 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  46.33 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  47.7 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  49.57 
 
 		 350 aa  322  5e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  49.86 
 
 		 372 aa  315  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  50.28 
 
 		 372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  46.74 
 
 		 362 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  50.14 
 
 		 357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  46.74 
 
 		 362 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  46.74 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  46.74 
 
 		 355 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  46.72 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  48.42 
 
 		 355 aa  305  9.000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  47.51 
 
 		 369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  46.42 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  46.42 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  46.42 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  52.19 
 
 		 362 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  46.42 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  46.42 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  46.42 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  46.42 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  46.42 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  46.42 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  45.98 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  47.41 
 
 		 354 aa  295  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  47.41 
 
 		 354 aa  295  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  47.41 
 
 		 354 aa  295  8e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  46.54 
 
 		 360 aa  292  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  49.57 
 
 		 356 aa  292  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  46.29 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  48.02 
 
 		 357 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  48.58 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  47.58 
 
 		 366 aa  289  6e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  45.74 
 
 		 361 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  48.58 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  48.3 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  47.69 
 
 		 353 aa  286  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  47.08 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  47.49 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  47.61 
 
 		 361 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  44.66 
 
 		 360 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  44.66 
 
 		 360 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  44.66 
 
 		 360 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  44.66 
 
 		 360 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  47.37 
 
 		 361 aa  276  6e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  46.96 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  49.85 
 
 		 363 aa  252  6e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  49.85 
 
 		 363 aa  252  6e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  35.56 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  34.88 
 
 		 357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  34.48 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.79 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  34.42 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  31.07 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  31.39 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  31.39 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.08 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.08 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  32.95 
 
 		 357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  33.43 
 
 		 357 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  33.43 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  33.76 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.87 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.14 
 
 		 351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  29.07 
 
 		 348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  30.42 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  30.42 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  33.03 
 
 		 357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  31.39 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  28.75 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  27.08 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  29.94 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.55 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.99 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  29.6 
 
 		 379 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  27.04 
 
 		 344 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  28.8 
 
 		 379 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>