More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002790 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  100 
 
 		 357 aa  701    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  91.85 
 
 		 356 aa  638    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  85.55 
 
 		 354 aa  585  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  75.43 
 
 		 355 aa  526  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  56.86 
 
 		 350 aa  408  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  57.1 
 
 		 356 aa  401  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  57.1 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  57.1 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  57.1 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  57.1 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  57.1 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  57.88 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  57.88 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  57.88 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  57.88 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  57.88 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  57.88 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  57.88 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  57.88 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  57.88 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  57.79 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  57.79 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  57.79 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  57.1 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  53.44 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  54.75 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  52.97 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  55.25 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  52.86 
 
 		 358 aa  358  6e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  52.94 
 
 		 357 aa  353  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  52.05 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  53.09 
 
 		 360 aa  352  7e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  55.83 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  51.87 
 
 		 357 aa  346  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  54.78 
 
 		 361 aa  345  6e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  52.78 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  53.89 
 
 		 366 aa  342  9e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  53.89 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  50.28 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  52.92 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  53.39 
 
 		 360 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  53.39 
 
 		 360 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  53.39 
 
 		 360 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  50.85 
 
 		 372 aa  338  8e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  53.39 
 
 		 360 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  53.48 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  52.54 
 
 		 361 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  45.15 
 
 		 365 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  48.73 
 
 		 359 aa  319  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  46.96 
 
 		 363 aa  319  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  48.99 
 
 		 363 aa  312  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  47.03 
 
 		 353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  50.72 
 
 		 356 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  48.55 
 
 		 358 aa  305  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  50.71 
 
 		 356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.55 
 
 		 356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  47.34 
 
 		 372 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  50.14 
 
 		 356 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  49.28 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  50.14 
 
 		 357 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  50.42 
 
 		 357 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  46.15 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  49.14 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  49 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  49 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  49 
 
 		 356 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  49.28 
 
 		 356 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  42.48 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  46.31 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  46.31 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  39.61 
 
 		 362 aa  232  9e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  28.16 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  28.57 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  30.13 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.3 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  29.97 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.23 
 
 		 354 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  29.79 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.5 
 
 		 343 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  30.75 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.88 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.81 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.87 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.88 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.88 
 
 		 361 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.88 
 
 		 361 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.88 
 
 		 361 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  29.73 
 
 		 363 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.56 
 
 		 361 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.56 
 
 		 361 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  29.48 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.87 
 
 		 348 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.02 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  30.37 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.96 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  28.69 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  27.46 
 
 		 371 aa  116  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.73 
 
 		 393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.79 
 
 		 355 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.79 
 
 		 355 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>