More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2001 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2001  permease  100 
 
 		 371 aa  727    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  35.15 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  35.93 
 
 		 369 aa  235  7e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  35.14 
 
 		 373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  34.88 
 
 		 361 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  34.6 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  34.6 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  34.6 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  34.6 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  34.88 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  34.88 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  33.69 
 
 		 375 aa  216  5e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  33.9 
 
 		 348 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  33.62 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  31.96 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  31.28 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  31.11 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  31.01 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  30.83 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  30.83 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  30.83 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  30.83 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  30.83 
 
 		 373 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  31.01 
 
 		 376 aa  175  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  32.95 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  29.32 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  31.04 
 
 		 373 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  29 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  29 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  27.91 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  27.97 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.48 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  27.27 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  29.79 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  30.84 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  32.08 
 
 		 361 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  32.08 
 
 		 361 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  30.75 
 
 		 361 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  28.77 
 
 		 368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  29.2 
 
 		 351 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  28.49 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  30.96 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.65 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  27.49 
 
 		 345 aa  136  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  27.71 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.11 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  26.65 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  27.79 
 
 		 417 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  29.13 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  28.07 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.52 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  27.24 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  27.37 
 
 		 366 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  27.6 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  28.74 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  26.16 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  26.51 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.65 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  26.84 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  26.16 
 
 		 376 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  26.16 
 
 		 376 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  27.53 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.2 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.63 
 
 		 351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.37 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  28.28 
 
 		 371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  28.96 
 
 		 435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  25.37 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  24.79 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  22.06 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  26.26 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  23.12 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  28.78 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  28.75 
 
 		 363 aa  109  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  26.46 
 
 		 354 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.91 
 
 		 355 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.91 
 
 		 355 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.91 
 
 		 355 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  26.46 
 
 		 354 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.91 
 
 		 355 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.91 
 
 		 355 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  26.46 
 
 		 354 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.49 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  27.01 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.2 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  28.96 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  26.49 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.7 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  25.66 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  25.66 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  25.07 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  25.66 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  25.66 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  25.66 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  25.66 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  25.66 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  25.66 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  25.66 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  28.16 
 
 		 354 aa  106  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  24.69 
 
 		 356 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>