More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1702 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  100 
 
 		 357 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  95.24 
 
 		 357 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  82.35 
 
 		 357 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  79.55 
 
 		 357 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  79.55 
 
 		 357 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  78.99 
 
 		 357 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  79.6 
 
 		 354 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  67.6 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  66.48 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  50 
 
 		 363 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  48.15 
 
 		 388 aa  315  7e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  51.9 
 
 		 389 aa  279  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  44.13 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  44.73 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  44.73 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  39.2 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.22 
 
 		 665 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  38.35 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  45.11 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  50 
 
 		 368 aa  232  9e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  45.4 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  37.75 
 
 		 366 aa  225  7e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  41.06 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  39.43 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  37.36 
 
 		 378 aa  222  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  45.95 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  39.16 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  39.33 
 
 		 374 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  39.22 
 
 		 374 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  38.97 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  38.97 
 
 		 356 aa  209  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  37.08 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  38.97 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  38.46 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  42.2 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  39.38 
 
 		 353 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  39.54 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  40.66 
 
 		 364 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  39.02 
 
 		 368 aa  202  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  38.81 
 
 		 379 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  38.68 
 
 		 374 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  37.36 
 
 		 382 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  39.76 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  39.76 
 
 		 375 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  37.36 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  38.07 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  37.76 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  40.6 
 
 		 434 aa  193  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  40.43 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  41.18 
 
 		 547 aa  186  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  39.6 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  39.6 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  37.88 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  39.48 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  38.81 
 
 		 358 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  31.84 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  41.52 
 
 		 353 aa  175  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  33.99 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  34.64 
 
 		 382 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  38.9 
 
 		 380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  37.18 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  36.61 
 
 		 329 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  36.56 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  39.38 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  36.8 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  36.59 
 
 		 382 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  34.38 
 
 		 452 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  30.84 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  32.5 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  32.04 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.27 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  30.86 
 
 		 368 aa  149  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  28.53 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  29.1 
 
 		 355 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  28.45 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  25.72 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  28.57 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  28.57 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  28.57 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  28.57 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  28.57 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  26.79 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  28.17 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  28.17 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.84 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  31.22 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.84 
 
 		 351 aa  135  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  27.95 
 
 		 373 aa  135  9e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.19 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.19 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.19 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.32 
 
 		 361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.89 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.9 
 
 		 361 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.9 
 
 		 361 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  32.92 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.19 
 
 		 361 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.19 
 
 		 361 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  27.19 
 
 		 348 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  32.92 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>