More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0259 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 356 aa  699    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  54.34 
 
 		 363 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  55.78 
 
 		 358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  55.27 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  53.01 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  54.93 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  52.68 
 
 		 372 aa  364  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  51.57 
 
 		 365 aa  364  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  54.07 
 
 		 354 aa  350  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  50.43 
 
 		 362 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  50.29 
 
 		 363 aa  325  8.000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  51.59 
 
 		 356 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  50.28 
 
 		 356 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.86 
 
 		 356 aa  322  6e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  46.15 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  46.26 
 
 		 350 aa  321  9.999999999999999e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  48.87 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  50.43 
 
 		 356 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  48.87 
 
 		 357 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  49 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  45.64 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  46.59 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  45.76 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  46.7 
 
 		 357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  46.57 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  45.85 
 
 		 355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  45.93 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  44.07 
 
 		 356 aa  297  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  45.76 
 
 		 358 aa  292  8e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  45.72 
 
 		 357 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  42.45 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  42.45 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  42.45 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  42.45 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  42.45 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  42.45 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  42.45 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  42.45 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  42.45 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  46.09 
 
 		 360 aa  290  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  43.64 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  45.01 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  41.45 
 
 		 355 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  41.21 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  44.19 
 
 		 361 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  41.45 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  41.45 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  41.45 
 
 		 355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  46.37 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  46.11 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  46.13 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  50.42 
 
 		 356 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  46 
 
 		 361 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  45.85 
 
 		 366 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  44.6 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  44.6 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  44.6 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  45.85 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  46.94 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  44.1 
 
 		 360 aa  280  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  46.53 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  46.53 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  46.53 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  46.53 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  42.03 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  47.09 
 
 		 363 aa  249  4e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  47.09 
 
 		 363 aa  249  4e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  35.1 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.8 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  27.07 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.72 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.92 
 
 		 390 aa  122  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  27.69 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  30.31 
 
 		 665 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  28.1 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.03 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.03 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.03 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.03 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.03 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  28.36 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.7 
 
 		 355 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.03 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.03 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  26.86 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  26.86 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.53 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.42 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  29.77 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  29.77 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  28.84 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  29.39 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.85 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  29.94 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>