More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2201 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  710    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  67.25 
 
 		 359 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  53.8 
 
 		 358 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  54.9 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  54.29 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  53.5 
 
 		 372 aa  355  5e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  49.58 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  51.57 
 
 		 356 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  45.15 
 
 		 357 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  48.33 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  46.24 
 
 		 350 aa  318  7e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  47.52 
 
 		 354 aa  316  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  45.35 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.7 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  45.79 
 
 		 354 aa  308  9e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  49.57 
 
 		 357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  48.99 
 
 		 357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  49.71 
 
 		 362 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  43.77 
 
 		 356 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  43.14 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  43.14 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  43.14 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  43.14 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  43.14 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  43.14 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  43.14 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  43.14 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  43.14 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  42.82 
 
 		 362 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  42.82 
 
 		 362 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  42.82 
 
 		 362 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  42.82 
 
 		 355 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  42.82 
 
 		 355 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  48.28 
 
 		 356 aa  291  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  43.06 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  44.94 
 
 		 358 aa  285  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  42.82 
 
 		 356 aa  285  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  47.7 
 
 		 356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  44.13 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  43.71 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  43.66 
 
 		 357 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  48.85 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  47.7 
 
 		 356 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  48.56 
 
 		 356 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  48.56 
 
 		 356 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  42.94 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  42.62 
 
 		 372 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  42.94 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  42.94 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  44.35 
 
 		 353 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  40.21 
 
 		 369 aa  276  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  41.53 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  41.08 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  43.02 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  41.58 
 
 		 366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  41.05 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  43.22 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  47.99 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  42.94 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  42.66 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  42.18 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  41.14 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  40.54 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  41.14 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  41.14 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  41.14 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  41.88 
 
 		 360 aa  249  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  41.24 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  41.24 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  35.53 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  30.65 
 
 		 348 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  30.26 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.06 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.86 
 
 		 351 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.73 
 
 		 343 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  28.88 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  32.53 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2454  hypothetical protein  27.69 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.44 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  31.85 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  29.59 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  29.71 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.16 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.23 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  28.03 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.08 
 
 		 375 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  27.08 
 
 		 358 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  26.2 
 
 		 357 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  29.25 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  26.14 
 
 		 344 aa  119  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  30.77 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  30.75 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.27 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.41 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  29.21 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2773  hypothetical protein  27.5 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  23.31 
 
 		 361 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  30.43 
 
 		 357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>