More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2627 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  100 
 
 		 353 aa  692    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 353 aa  692    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  93.75 
 
 		 355 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  692    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  100 
 
 		 353 aa  692    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  100 
 
 		 353 aa  692    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  692    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  100 
 
 		 353 aa  692    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  100 
 
 		 353 aa  692    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  94.03 
 
 		 362 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  93.77 
 
 		 362 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  94.03 
 
 		 362 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  94.03 
 
 		 355 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  100 
 
 		 353 aa  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  91.5 
 
 		 353 aa  622  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  77.23 
 
 		 356 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  78.1 
 
 		 354 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  78.1 
 
 		 354 aa  530  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  78.1 
 
 		 354 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  56.98 
 
 		 350 aa  408  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  57.88 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  58.5 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  57.02 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  56.65 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  51.84 
 
 		 361 aa  352  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  49.43 
 
 		 369 aa  342  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  51.53 
 
 		 360 aa  334  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  50.71 
 
 		 366 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  51.01 
 
 		 356 aa  329  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  50.85 
 
 		 360 aa  326  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  50 
 
 		 372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  50 
 
 		 357 aa  325  9e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  50.71 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  50.71 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  50.71 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  50.71 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  48.27 
 
 		 358 aa  319  6e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  50 
 
 		 366 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  49.57 
 
 		 366 aa  318  9e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  49.86 
 
 		 357 aa  318  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  49.29 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  49.29 
 
 		 361 aa  315  7e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  49.44 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  47.11 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  49.86 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  50.14 
 
 		 361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  44.22 
 
 		 356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.41 
 
 		 356 aa  298  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  45.56 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  43.14 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  46.55 
 
 		 363 aa  291  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  45.89 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  49.86 
 
 		 357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  49.28 
 
 		 357 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  42.61 
 
 		 372 aa  279  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  47.85 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  43.19 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  42.45 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  46.42 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  48.86 
 
 		 356 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  48.86 
 
 		 356 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  45.85 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  48.57 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  45.69 
 
 		 362 aa  259  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  43.06 
 
 		 358 aa  259  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  48.43 
 
 		 356 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  40.23 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  46.18 
 
 		 363 aa  232  6e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  46.18 
 
 		 363 aa  232  6e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  34.71 
 
 		 362 aa  173  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  30.13 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  30.82 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  29.75 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.44 
 
 		 343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.09 
 
 		 374 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  30.82 
 
 		 379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  29.21 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  31.71 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  31.99 
 
 		 357 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  31.1 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  32.1 
 
 		 357 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.05 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  31.4 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  32.92 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  31.97 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  30.72 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  29.48 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  29.67 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  26.27 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  27.91 
 
 		 434 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 		 351 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  29.43 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  27.61 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  30.07 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  27.06 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  30.43 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  30.34 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  29.21 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  28.01 
 
 		 375 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>