More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1693 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  696    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  57.87 
 
 
356 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.85 
 
 
356 aa  342  5e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  52.27 
 
 
358 aa  342  5e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  55.46 
 
 
356 aa  342  9e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  56.34 
 
 
356 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  56.06 
 
 
357 aa  338  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  56.34 
 
 
357 aa  338  8e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  55.49 
 
 
356 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  50.29 
 
 
372 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  50.98 
 
 
363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  48.55 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  55.08 
 
 
356 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  55.08 
 
 
356 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  49.29 
 
 
353 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  55.08 
 
 
356 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  47.03 
 
 
356 aa  322  6e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  47.59 
 
 
356 aa  315  6e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  44.79 
 
 
363 aa  301  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  46.63 
 
 
355 aa  301  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  44.94 
 
 
365 aa  301  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  46.99 
 
 
372 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  47.77 
 
 
359 aa  299  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  46.37 
 
 
357 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  55.18 
 
 
356 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  45.48 
 
 
354 aa  289  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  46.33 
 
 
356 aa  289  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  41.91 
 
 
362 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  41.91 
 
 
362 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  41.91 
 
 
362 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  41.91 
 
 
355 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  43.06 
 
 
353 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  43.06 
 
 
353 aa  285  8e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  43.06 
 
 
353 aa  285  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  43.06 
 
 
353 aa  285  8e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  43.06 
 
 
353 aa  285  8e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  43.06 
 
 
353 aa  285  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  43.06 
 
 
353 aa  285  8e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  43.06 
 
 
353 aa  285  8e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  43.06 
 
 
353 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  41.91 
 
 
355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  42 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  45.76 
 
 
356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  41.55 
 
 
369 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  45.38 
 
 
372 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  42.61 
 
 
354 aa  275  9e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  42.61 
 
 
354 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  42.61 
 
 
354 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  44.99 
 
 
366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  44.54 
 
 
366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  44.7 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  45.54 
 
 
357 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  42.94 
 
 
360 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  41.9 
 
 
353 aa  270  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  43.47 
 
 
361 aa  269  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  41 
 
 
360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  45.11 
 
 
354 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  42.54 
 
 
366 aa  265  7e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  41.04 
 
 
356 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  42.86 
 
 
361 aa  265  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  43.47 
 
 
360 aa  260  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  42.32 
 
 
360 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  42.32 
 
 
360 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  42.32 
 
 
360 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  42.32 
 
 
360 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  45.99 
 
 
362 aa  256  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  42.25 
 
 
361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  42.13 
 
 
366 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  44.51 
 
 
363 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  44.51 
 
 
363 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  34.69 
 
 
362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  28.67 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.03 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.97 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.48 
 
 
390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.16 
 
 
355 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.16 
 
 
355 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.57 
 
 
396 aa  116  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.66 
 
 
355 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.66 
 
 
355 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.66 
 
 
355 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.66 
 
 
355 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.66 
 
 
355 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  27.5 
 
 
352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  27.59 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  27.53 
 
 
357 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  29.17 
 
 
434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  27.07 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  25.66 
 
 
356 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.32 
 
 
343 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 
351 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.74 
 
 
361 aa  106  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  25.66 
 
 
355 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  30.07 
 
 
357 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  29.15 
 
 
398 aa  106  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25 
 
 
369 aa  106  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.44 
 
 
379 aa  106  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  23.49 
 
 
341 aa  105  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  30.07 
 
 
357 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.629251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>