More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1347 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1347  permease  100 
 
 		 393 aa  784    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  39.74 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  37.88 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  36.57 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  36.83 
 
 		 382 aa  255  8e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  35.84 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  35.84 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  35.62 
 
 		 373 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  35.34 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  35.34 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  35.34 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  35.34 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  35.34 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  35.07 
 
 		 376 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  35.34 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  35.34 
 
 		 373 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  36.04 
 
 		 373 aa  239  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  34.04 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  35.55 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  30.9 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  31.5 
 
 		 361 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  31.21 
 
 		 361 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  31.21 
 
 		 361 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  31.21 
 
 		 361 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  31.21 
 
 		 361 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  31.21 
 
 		 361 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  31.21 
 
 		 361 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  31.36 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  31.36 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  31.32 
 
 		 361 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  33.71 
 
 		 361 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  33.71 
 
 		 361 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  32.19 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  31.01 
 
 		 375 aa  169  8e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  29.79 
 
 		 369 aa  162  7e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  32.87 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  26.87 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  31.5 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.69 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  29.11 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.77 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.16 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  26.61 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  28.08 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  30.52 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  26.73 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.33 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  23.55 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.04 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.33 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  28.96 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  27.84 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  25.83 
 
 		 357 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  26.07 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  26.87 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  26.11 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  26.22 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.74 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  26.65 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  26.48 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  27.39 
 
 		 363 aa  123  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  27.06 
 
 		 363 aa  123  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  27.33 
 
 		 350 aa  123  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  28.1 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  30.14 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  25.95 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  28.75 
 
 		 358 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  26.04 
 
 		 355 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.27 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0071  protein of unknown function UPF0118  25.14 
 
 		 435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  25.74 
 
 		 356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  23.29 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25.71 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  26.41 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.63 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  25.3 
 
 		 357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.79 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  26.73 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  25.56 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  28.44 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  26.65 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  24.84 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.47 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  24.38 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  27.89 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  25.86 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.65 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  27.14 
 
 		 370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  27.14 
 
 		 370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  24.55 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 		 372 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  27.49 
 
 		 547 aa  112  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  26.57 
 
 		 356 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  27.19 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>