More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1649 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  706    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  77.5 
 
 		 369 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  78.92 
 
 		 366 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  78.24 
 
 		 366 aa  548  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  77.96 
 
 		 366 aa  547  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  77.69 
 
 		 366 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  76.11 
 
 		 360 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  78.86 
 
 		 361 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  77.22 
 
 		 366 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  76.39 
 
 		 360 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  76.39 
 
 		 360 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  76.39 
 
 		 360 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  75.77 
 
 		 372 aa  528  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  76.39 
 
 		 360 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  75.9 
 
 		 361 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  77.27 
 
 		 360 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  53.78 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  52.82 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  52.82 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  52.82 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  52.82 
 
 		 355 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  54.27 
 
 		 356 aa  359  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  52.14 
 
 		 356 aa  359  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  52.82 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  55.06 
 
 		 354 aa  355  8.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  55.46 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  53.69 
 
 		 357 aa  354  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  51.27 
 
 		 361 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  50.85 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  50.85 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  50.85 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  50.85 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  50.85 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  50.85 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  50.85 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  50.85 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  50.85 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  49.86 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  49.86 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  49.86 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  49.86 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  51.7 
 
 		 353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  50.99 
 
 		 357 aa  324  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  49.01 
 
 		 350 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  46.48 
 
 		 358 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  43.29 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  44.44 
 
 		 356 aa  295  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  44.38 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  44.32 
 
 		 359 aa  288  9e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.19 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  46.09 
 
 		 356 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  42.31 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  49.31 
 
 		 357 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  48.75 
 
 		 357 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  45.11 
 
 		 353 aa  278  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  47.06 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  47.12 
 
 		 356 aa  271  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  46.85 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  46.3 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  42.74 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  44.32 
 
 		 363 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  45.79 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  41 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  46.81 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  46.54 
 
 		 356 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  46.54 
 
 		 356 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  45.15 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  42.94 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  42.94 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  39.65 
 
 		 354 aa  222  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  34.72 
 
 		 362 aa  189  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.95 
 
 		 343 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  25.78 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  26.54 
 
 		 344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  28.79 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2454  hypothetical protein  30.43 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  28.53 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.47 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.7 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  26.4 
 
 		 357 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  28.34 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.52 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.85 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.85 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.85 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.85 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.85 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.52 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.92 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.92 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.03 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.93 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  24.48 
 
 		 369 aa  106  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1589  protein of unknown function UPF0118  28.08 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  26.09 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0858  protein of unknown function UPF0118  26.51 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.640782  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  26.89 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.93 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  26.33 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  29.25 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>