More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1757 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  707    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  78.49 
 
 		 369 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  80.46 
 
 		 366 aa  557  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  76.11 
 
 		 360 aa  546  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  77.41 
 
 		 366 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  77.69 
 
 		 366 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  77.41 
 
 		 366 aa  541  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  78 
 
 		 361 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  74.72 
 
 		 360 aa  527  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  74.72 
 
 		 360 aa  527  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  74.72 
 
 		 360 aa  527  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  74.72 
 
 		 360 aa  527  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  74.93 
 
 		 372 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  76.8 
 
 		 366 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  76.94 
 
 		 360 aa  518  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  77.56 
 
 		 361 aa  521  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  52.2 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  52.26 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  52.26 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  52.26 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  52.78 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  52.26 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  52.26 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  51.53 
 
 		 353 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  51.53 
 
 		 353 aa  360  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  51.53 
 
 		 353 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  51.53 
 
 		 353 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  51.53 
 
 		 353 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  51.53 
 
 		 353 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  51.53 
 
 		 353 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  51.53 
 
 		 353 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  51.53 
 
 		 353 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  53.82 
 
 		 354 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  53.82 
 
 		 354 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  53.82 
 
 		 354 aa  359  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  53.33 
 
 		 356 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  56.09 
 
 		 354 aa  351  8.999999999999999e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  51.56 
 
 		 361 aa  351  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  53.69 
 
 		 355 aa  345  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  52.84 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  52.66 
 
 		 353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  48.88 
 
 		 356 aa  335  7e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  51.12 
 
 		 350 aa  333  2e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  52.41 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  48.16 
 
 		 358 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  45.35 
 
 		 372 aa  312  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  45.43 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  44.13 
 
 		 365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  45.74 
 
 		 356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  43.01 
 
 		 363 aa  289  6e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  45.79 
 
 		 353 aa  288  9e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  49.15 
 
 		 357 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  49.15 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  48.2 
 
 		 356 aa  275  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  45.2 
 
 		 363 aa  275  8e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  45.17 
 
 		 372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.22 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  44.1 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  47.08 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  46.8 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  46.65 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  45.07 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  42.94 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  46.61 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  46.33 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  46.33 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  44.13 
 
 		 363 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  44.13 
 
 		 363 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  46.61 
 
 		 356 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  38.11 
 
 		 354 aa  225  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  35.31 
 
 		 362 aa  182  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.99 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  27.04 
 
 		 396 aa  125  9e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  27.51 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  28.36 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  25.31 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  28.03 
 
 		 348 aa  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.78 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.45 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0858  protein of unknown function UPF0118  27.38 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.640782  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  26.38 
 
 		 418 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.88 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.88 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.14 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.2 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.2 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.54 
 
 		 379 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.92 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  27.03 
 
 		 363 aa  106  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  26.42 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.24 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.24 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.24 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.24 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.24 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  23.95 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  25.4 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.08 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2454  hypothetical protein  28.52 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>