More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0662 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0662  permease, putative  100 
 
 		 362 aa  707    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  57.8 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  54.26 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  55.93 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  52.87 
 
 		 372 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  50.28 
 
 		 363 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  52.57 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  49.71 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  50.43 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  49.14 
 
 		 357 aa  329  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  55.11 
 
 		 357 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  49.57 
 
 		 363 aa  324  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  55.11 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  49.41 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  49.71 
 
 		 355 aa  319  5e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  52.77 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  45.09 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  53.35 
 
 		 356 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  49.43 
 
 		 354 aa  316  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.73 
 
 		 356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  52.77 
 
 		 356 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  52.19 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  45.77 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  48.29 
 
 		 356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  47.37 
 
 		 357 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  48.41 
 
 		 361 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  52.19 
 
 		 356 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  52.19 
 
 		 356 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  45.13 
 
 		 353 aa  298  9e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  44.83 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  44.83 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  44.83 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  44.83 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  44.83 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  44.83 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  44.83 
 
 		 355 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  44.83 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  52.19 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  44.83 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  44.83 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  44.83 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  44.83 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  44.83 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  44.83 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  45.4 
 
 		 369 aa  293  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  45.07 
 
 		 360 aa  292  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  44.64 
 
 		 354 aa  292  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  44.64 
 
 		 354 aa  292  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  44.64 
 
 		 354 aa  292  7e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  45.79 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  44.19 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  44.92 
 
 		 354 aa  285  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  44.38 
 
 		 366 aa  285  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  47.23 
 
 		 366 aa  285  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  47.57 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  44.77 
 
 		 353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  49.48 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  49.13 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  49.13 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  49.13 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  49.13 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  49.13 
 
 		 366 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  49.13 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  48.49 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  52.48 
 
 		 356 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  45.53 
 
 		 358 aa  276  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  48.45 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  50.38 
 
 		 360 aa  269  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  44.29 
 
 		 363 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  44.29 
 
 		 363 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  35.53 
 
 		 362 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  29.01 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.59 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  27.54 
 
 		 348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  30.94 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.84 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.3 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  30.89 
 
 		 357 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.48 
 
 		 341 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.41 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  27.27 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  29.06 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  28.92 
 
 		 370 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  28.62 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  30.16 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.78 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  26.55 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.2 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.2 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.88 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.88 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.88 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.88 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.88 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  25.5 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.15 
 
 		 361 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  28.8 
 
 		 665 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.81 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>