More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2774 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2454  hypothetical protein  72.3 
 
 		 346 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  61.22 
 
 		 348 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  53.87 
 
 		 344 aa  358  9e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  53.91 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  39.01 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2773  hypothetical protein  39.13 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2453  hypothetical protein  40.29 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  31.68 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.73 
 
 		 396 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  30.48 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  27.79 
 
 		 358 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  29.94 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  29.94 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  29.18 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  29.79 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  27.53 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  29.34 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  29.3 
 
 		 372 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  29.25 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  27.74 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  29.25 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  28.74 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  29.02 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.5 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  28.88 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  29.02 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 		 356 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  28.9 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  28.9 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  28.9 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  28.9 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  28.9 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  28.9 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  28.9 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  28.9 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  28.9 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  28.78 
 
 		 357 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.12 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  29.66 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  29.87 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.27 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  29.97 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  25.7 
 
 		 370 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.71 
 
 		 344 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  27.79 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  27.79 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  27.79 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  28.03 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  27.64 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  28.4 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  28.15 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  29.43 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  27.01 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  31.82 
 
 		 665 aa  116  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.21 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  31.07 
 
 		 357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  27.02 
 
 		 358 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.56 
 
 		 393 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.44 
 
 		 374 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.76 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  27.39 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.12 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.12 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.12 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.12 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  28.52 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.12 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  28.52 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  27.42 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  28.52 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  27.44 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  29.63 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  27.04 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.76 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  27.1 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  29.11 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  30.16 
 
 		 372 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  27.1 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  27.1 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  27.1 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  27.1 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.44 
 
 		 355 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  27.1 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.1 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  30.69 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.08 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  29.33 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.08 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  28.71 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  25.66 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  29.97 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  29.19 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  27.01 
 
 		 415 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.18 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  28.03 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  27.01 
 
 		 382 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  27.22 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  28.79 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>