More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0929 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  807    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  78.7 
 
 		 402 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  78.7 
 
 		 402 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  38.61 
 
 		 393 aa  264  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  40.93 
 
 		 376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  40.93 
 
 		 373 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  40.16 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  40.93 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  40.16 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  40.16 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  40.16 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  40.38 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  40.11 
 
 		 373 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  38.74 
 
 		 373 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  34.5 
 
 		 373 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  35.31 
 
 		 361 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  35.88 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  35.88 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  36.15 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  36.15 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  36.15 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  36.15 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  36.15 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  36.15 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  32.82 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  35.41 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  31.1 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  32.46 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  32.89 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  36.59 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  36.59 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  32.9 
 
 		 375 aa  193  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  31.83 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  33.55 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  27.74 
 
 		 382 aa  177  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  35.28 
 
 		 361 aa  176  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  32.82 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.33 
 
 		 343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  28.83 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  27.91 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  28.53 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  28.53 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  28.53 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  28.53 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  28.53 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  27.93 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  27.93 
 
 		 355 aa  159  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.03 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  27.93 
 
 		 355 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  29.88 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  28.82 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  28.74 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  27.93 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  27.63 
 
 		 417 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  24.32 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  28.71 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.48 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  24.49 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.81 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  27.06 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.92 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  28.7 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  27.67 
 
 		 382 aa  129  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.95 
 
 		 351 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  25.73 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  26.9 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  24.72 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  27.53 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  25.48 
 
 		 374 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  25.31 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25.96 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  27.59 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  26.96 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  24.81 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  26.44 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.5 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  26.26 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  23.84 
 
 		 360 aa  123  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  24.47 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  29.17 
 
 		 329 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  24.23 
 
 		 363 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2773  hypothetical protein  28.91 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  23.68 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  26.79 
 
 		 382 aa  119  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.63 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  25.4 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  26.71 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  24.76 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  25.28 
 
 		 354 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  25.08 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  24.15 
 
 		 345 aa  116  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  27.87 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  24.12 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  25.8 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  25.55 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  24.35 
 
 		 357 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  24.33 
 
 		 357 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  23.65 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>