More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2454 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2454  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  72.3 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  61.05 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  53.41 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  52.17 
 
 		 357 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  38.75 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2773  hypothetical protein  37.83 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2453  hypothetical protein  40.56 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  31.37 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  28.27 
 
 		 365 aa  133  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  30.38 
 
 		 343 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  29.69 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  28.84 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.2 
 
 		 345 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  26.95 
 
 		 357 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  27.78 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  27.55 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.72 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  27.55 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  29.64 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  30.27 
 
 		 665 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  30.48 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  27.41 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  27.62 
 
 		 374 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.4 
 
 		 355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.4 
 
 		 355 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.3 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.3 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.3 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.3 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.3 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  27.25 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  28.3 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.61 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  26.35 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  30.74 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.62 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  30.36 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.88 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  28.1 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  27.14 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  29.28 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  28.15 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.42 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.84 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  24.29 
 
 		 357 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.96 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.08 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.08 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.08 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.08 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  28.92 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  27.45 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  27.45 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  27.87 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.75 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.23 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  27.45 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  27.45 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  27.45 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  27.45 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  27.87 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  27.45 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  27.45 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  27.87 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  27.45 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.75 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.42 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.75 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.42 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  28.96 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  37.7 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  26.52 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.41 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.69 
 
 		 402 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.69 
 
 		 402 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  25.77 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  29.14 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  29.38 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.22 
 
 		 368 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.76 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  23.81 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  24.92 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  28.09 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  33.71 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  28.09 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  28.09 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  30.2 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  28.09 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  29.32 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  26.1 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  24.61 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  27.99 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  27.24 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  27.81 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  28.35 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.42 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  26.96 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>