More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05740 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  100 
 
 
351 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  36.89 
 
 
344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  35.96 
 
 
349 aa  216  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  35.74 
 
 
343 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  36.69 
 
 
341 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  31.9 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  35.78 
 
 
349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  32.55 
 
 
351 aa  179  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  30.98 
 
 
396 aa  176  7e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  34.19 
 
 
368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  30.74 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  30.74 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  30.74 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  30.74 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  30.74 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  32.78 
 
 
339 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.25 
 
 
354 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  29.77 
 
 
355 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  29.77 
 
 
355 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  29.77 
 
 
355 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.25 
 
 
363 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.9 
 
 
368 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  28.79 
 
 
378 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  30.59 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.06 
 
 
370 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  29.77 
 
 
356 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  29.71 
 
 
373 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  29.71 
 
 
348 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  29.71 
 
 
361 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.78 
 
 
390 aa  150  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  29.71 
 
 
361 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  29.71 
 
 
361 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  29.65 
 
 
361 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  29.65 
 
 
361 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  29.65 
 
 
361 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  29.65 
 
 
348 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  29.91 
 
 
353 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  29.94 
 
 
361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  30.74 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  30.57 
 
 
361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 
361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  30.03 
 
 
370 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 
370 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.69 
 
 
379 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  31.82 
 
 
382 aa  146  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  30.67 
 
 
352 aa  146  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  30.56 
 
 
415 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  28.17 
 
 
417 aa  145  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  31.49 
 
 
382 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  31.31 
 
 
354 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  26.61 
 
 
388 aa  142  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.96 
 
 
374 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  31.56 
 
 
368 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  29.74 
 
 
370 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  30.77 
 
 
379 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  29.02 
 
 
365 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  24.53 
 
 
357 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  24.84 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  28.08 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  28.43 
 
 
374 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  31.25 
 
 
372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  24.92 
 
 
360 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  24.92 
 
 
357 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  27.75 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  29.06 
 
 
434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  27.84 
 
 
435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  26.21 
 
 
392 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  25.79 
 
 
354 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  25.79 
 
 
357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  25.24 
 
 
357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  26.52 
 
 
375 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  27.6 
 
 
374 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  26.52 
 
 
358 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  26.72 
 
 
382 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  28.35 
 
 
665 aa  132  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  29.01 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  27 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  26.54 
 
 
363 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  28 
 
 
402 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  28 
 
 
402 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  26.59 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  29.01 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  28.33 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  28.18 
 
 
547 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  28.7 
 
 
373 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  29.01 
 
 
373 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  26.72 
 
 
375 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  28.7 
 
 
376 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  28.7 
 
 
373 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  28.7 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  28.7 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  28.7 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  25.72 
 
 
364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  26.56 
 
 
436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.97 
 
 
371 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  28.62 
 
 
373 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  27.71 
 
 
404 aa  125  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  29.69 
 
 
345 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  26.93 
 
 
382 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>