More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2453 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2453  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2773  hypothetical protein  79.14 
 
 		 350 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  61.51 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  40.75 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  37.5 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2454  hypothetical protein  40.07 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  35.19 
 
 		 344 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  38.11 
 
 		 357 aa  209  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  31.97 
 
 		 363 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.53 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.85 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.13 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  29.55 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  29.39 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  28.04 
 
 		 393 aa  125  9e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.48 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  26.69 
 
 		 405 aa  122  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  28.34 
 
 		 379 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  29.84 
 
 		 370 aa  119  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.33 
 
 		 396 aa  119  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  29.84 
 
 		 370 aa  119  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  29.17 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.86 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  27.33 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  27.33 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  27.73 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  27.27 
 
 		 370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  29.17 
 
 		 357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  29.47 
 
 		 375 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  29.47 
 
 		 358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  28.98 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  27.67 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  29.1 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  26.23 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  28.93 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  29.04 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  28.93 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  27.74 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  27.04 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.25 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  30.35 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  25.86 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  27.65 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  26.54 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.21 
 
 		 415 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  30.19 
 
 		 368 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.16 
 
 		 354 aa  109  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  30.19 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  27.96 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  28.1 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  29.61 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.71 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  27.44 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  29.17 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  27.18 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  28.85 
 
 		 357 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  27.33 
 
 		 372 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  27.62 
 
 		 364 aa  105  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.27 
 
 		 398 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  27.67 
 
 		 357 aa  105  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  30.95 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.46 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  26.44 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  28.2 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.72 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.15 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  23.37 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  27.87 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.41 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  28.98 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.63 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  27.65 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0662  protein of unknown function UPF0118  28.85 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.36 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  30.82 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  26.65 
 
 		 665 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  30.36 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  27.65 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  25.81 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.7 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.7 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.7 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.7 
 
 		 348 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  29.1 
 
 		 375 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  23.23 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  26.74 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.7 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.7 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  27.05 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.7 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  26.74 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  26.74 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25.4 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.7 
 
 		 361 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>