More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0713 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0713  permease, putative  100 
 
 		 382 aa  756    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  89.27 
 
 		 415 aa  664    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  99.48 
 
 		 382 aa  753    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  62.11 
 
 		 378 aa  488  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  60.75 
 
 		 379 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  62.67 
 
 		 379 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  61.35 
 
 		 374 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  62.43 
 
 		 374 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  57.63 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  50.94 
 
 		 374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  49.32 
 
 		 418 aa  349  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  50.13 
 
 		 370 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  50.13 
 
 		 370 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  50.42 
 
 		 382 aa  336  5e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  50.27 
 
 		 370 aa  328  9e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  51.15 
 
 		 382 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  50.29 
 
 		 375 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  46.9 
 
 		 375 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  47.78 
 
 		 358 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  49.47 
 
 		 382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  46.15 
 
 		 398 aa  305  9.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  46.81 
 
 		 357 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  46.37 
 
 		 361 aa  297  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  48.85 
 
 		 365 aa  295  8e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  45.5 
 
 		 380 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  46.63 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  44.38 
 
 		 434 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  39.64 
 
 		 364 aa  236  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  41.34 
 
 		 547 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  37.4 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  37.46 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  38.29 
 
 		 357 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  37.36 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  38.32 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  37.04 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  36.49 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  37.5 
 
 		 665 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  37.04 
 
 		 354 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  37.04 
 
 		 357 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  37.94 
 
 		 357 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  33.43 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  35.01 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  32.23 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  33.84 
 
 		 367 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  34.48 
 
 		 356 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  33.63 
 
 		 356 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  33.23 
 
 		 368 aa  179  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  32.42 
 
 		 452 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  34.75 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  34.87 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  34.87 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  33.64 
 
 		 356 aa  170  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  34.02 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  37.54 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  33.94 
 
 		 353 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  32.48 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  33.53 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  37.24 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  30.7 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  29.81 
 
 		 396 aa  163  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  30.12 
 
 		 373 aa  163  6e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  31.72 
 
 		 366 aa  162  9e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  35.03 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  35.22 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  37.28 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  35.49 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  31.63 
 
 		 370 aa  156  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  31.4 
 
 		 351 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  34.04 
 
 		 364 aa  155  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  31.75 
 
 		 327 aa  153  5.9999999999999996e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  33.97 
 
 		 358 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  29.82 
 
 		 357 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  30.27 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  29.88 
 
 		 369 aa  143  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  31.63 
 
 		 353 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  32.85 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  28.09 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  25.79 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  31.85 
 
 		 329 aa  139  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  30.22 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  30.22 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  30.22 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  30.22 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  30.22 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  30.22 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  30.22 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  30.22 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  30.22 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  36.83 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  29.79 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  29.79 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  29.79 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  29.79 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  29.79 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.39 
 
 		 354 aa  132  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.86 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  27.35 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  28.53 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.52 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.36 
 
 		 361 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>