More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2624 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  100 
 
 		 356 aa  685    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  88.76 
 
 		 356 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  87.64 
 
 		 356 aa  597  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  68.82 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  55.77 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  55.49 
 
 		 383 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  56.9 
 
 		 358 aa  348  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  49.57 
 
 		 356 aa  333  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  52.01 
 
 		 353 aa  309  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  50.57 
 
 		 353 aa  285  9e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  48.13 
 
 		 368 aa  278  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  46.22 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  44.71 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  40.29 
 
 		 665 aa  242  7e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  40.24 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  40.11 
 
 		 388 aa  216  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  38.57 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  39.26 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  41.03 
 
 		 360 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  38.97 
 
 		 357 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  39.26 
 
 		 357 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  38.11 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  38.11 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  39.26 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  39.31 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  39.81 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  36.89 
 
 		 363 aa  189  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  34.49 
 
 		 378 aa  185  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  34.32 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  33.15 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  34.32 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  34.45 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  36.34 
 
 		 364 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  35.51 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  33.24 
 
 		 415 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  34.46 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  41.03 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  35.14 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  35.03 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  33.72 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  31.65 
 
 		 404 aa  170  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  32.84 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  39.46 
 
 		 389 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  33.53 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  42.11 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  32.55 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  34.23 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  28.9 
 
 		 354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  35.38 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  35.08 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  37.36 
 
 		 364 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  32.16 
 
 		 418 aa  162  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  32.54 
 
 		 370 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  33.52 
 
 		 398 aa  162  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  35.36 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  32.78 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  35.52 
 
 		 547 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  36 
 
 		 357 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  34.86 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  39.75 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  26.93 
 
 		 379 aa  145  9e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  34.32 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  34.32 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  29.32 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  34.86 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  30.51 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  35.8 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  33.62 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  34.09 
 
 		 382 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  32.85 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  31.09 
 
 		 452 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  28.3 
 
 		 355 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  28.3 
 
 		 355 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  28.3 
 
 		 355 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  28.3 
 
 		 355 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  28.3 
 
 		 355 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  28.62 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  28.71 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  28.39 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  30.5 
 
 		 365 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  26.01 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.88 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  31.23 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  28.62 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  28.62 
 
 		 355 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  29.39 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.13 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.52 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.37 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.57 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  31.85 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.07 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  27.22 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  28.57 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0858  protein of unknown function UPF0118  25.66 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.640782  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  28.7 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 		 358 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.58 
 
 		 369 aa  112  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1589  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  25.86 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>