More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0555 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 364 aa  684    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  49.26 
 
 		 388 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  46.9 
 
 		 363 aa  265  8.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  47.24 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  46.94 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  46.24 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  48.66 
 
 		 357 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  45.95 
 
 		 357 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  52.47 
 
 		 368 aa  242  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  47.55 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  47.55 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  47.43 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  46.65 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  48.16 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  46.04 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  46.36 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  47.55 
 
 		 385 aa  228  9e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  48.29 
 
 		 360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  37.76 
 
 		 368 aa  216  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  37.76 
 
 		 367 aa  215  8e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  42.36 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  41.18 
 
 		 665 aa  206  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  48.37 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  40.48 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  36.28 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  38.76 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  38.21 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  36.49 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  37.11 
 
 		 358 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  39.64 
 
 		 374 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  37.22 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  37.23 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  39.51 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  39.09 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  39.29 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  40.84 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  38.28 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  40.06 
 
 		 356 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  39 
 
 		 356 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  38.23 
 
 		 364 aa  175  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  39.26 
 
 		 356 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  34.82 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  38.33 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  38.33 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  34.65 
 
 		 415 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  39.26 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  39.26 
 
 		 358 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  38.44 
 
 		 356 aa  170  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  39.17 
 
 		 547 aa  169  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  35.86 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  42.07 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  42.4 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  36.62 
 
 		 379 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  37.57 
 
 		 380 aa  166  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  37.69 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  34.07 
 
 		 344 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  38.33 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  28.28 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  40.84 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  27.11 
 
 		 354 aa  159  8e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  33.52 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  34.86 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  37.08 
 
 		 357 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  33.24 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  35.05 
 
 		 329 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  33.14 
 
 		 404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  29.29 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  37.9 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  34.38 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  38.53 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  33.43 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  27.51 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  37.88 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  34.81 
 
 		 329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.48 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  28.83 
 
 		 351 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  30.45 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  30.53 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  30.13 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  29.75 
 
 		 355 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  29.75 
 
 		 355 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  29.75 
 
 		 355 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  29.75 
 
 		 355 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  29.75 
 
 		 355 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.65 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.65 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  29.75 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  30.13 
 
 		 352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  29.75 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.1 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  29.38 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  29.1 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  30.96 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.62 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.46 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  26.65 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.91 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  32.82 
 
 		 353 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.89 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  34.08 
 
 		 371 aa  115  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>