More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1713 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  715    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  40.33 
 
 		 369 aa  228  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  36.59 
 
 		 369 aa  212  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  36.09 
 
 		 369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2477  hypothetical protein  37.6 
 
 		 378 aa  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.88 
 
 		 354 aa  135  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  28.34 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.92 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  28.34 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  28.88 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  28.66 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.07 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27.85 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.85 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.85 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  27.07 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  27.85 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.07 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  27.07 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.07 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  29.67 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  29.56 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  28.45 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  29.35 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  27.97 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  29.03 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.68 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  29.03 
 
 		 373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  29.03 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  29.03 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  31.86 
 
 		 434 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  29.03 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  29.03 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  29.03 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  28.23 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  29.03 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  29.03 
 
 		 373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.51 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.33 
 
 		 349 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  25.95 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  28.23 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  28.91 
 
 		 547 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  32.84 
 
 		 357 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.09 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  28.39 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  32.87 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  26.23 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  26.93 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.6 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.6 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.97 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  29.79 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  30.66 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  29.1 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  32.59 
 
 		 357 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  29.65 
 
 		 374 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  28.79 
 
 		 356 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.86 
 
 		 355 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.86 
 
 		 355 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.86 
 
 		 355 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.86 
 
 		 355 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.86 
 
 		 355 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  31.27 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  31.27 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.66 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  27.65 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  27.42 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  27.71 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  28.25 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  31.4 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  28.29 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.85 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.54 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  31.12 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.54 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  31.68 
 
 		 387 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.21 
 
 		 355 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  28.19 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  26.73 
 
 		 460 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  32.23 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.55 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  28.26 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  25.68 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  25 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 374 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  26.36 
 
 		 372 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  26.29 
 
 		 380 aa  106  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  28.88 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  26.87 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  27 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  24.25 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  31.73 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  28.2 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  32.83 
 
 		 429 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  27.3 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.68 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  28.66 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  23.37 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.87 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  31.25 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>