More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2488 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  700    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  84.92 
 
 		 358 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  84.08 
 
 		 383 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  55.77 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  55.21 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  55.21 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  51.83 
 
 		 356 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  48.01 
 
 		 356 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  52.71 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  49.54 
 
 		 353 aa  285  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  46.76 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  42.3 
 
 		 329 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  43.23 
 
 		 665 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  41.99 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  40.36 
 
 		 363 aa  232  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  38.86 
 
 		 357 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  37.28 
 
 		 363 aa  203  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  38.37 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  36.78 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  37.07 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  37.07 
 
 		 354 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  38.55 
 
 		 360 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  37.76 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  38.08 
 
 		 347 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  38.08 
 
 		 347 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  37.32 
 
 		 388 aa  192  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  37.36 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  35.91 
 
 		 418 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  34.83 
 
 		 374 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  33.43 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  36.61 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  38.6 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  38.6 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  34.35 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  33.97 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  34.38 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  37.46 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  37.64 
 
 		 368 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  29.11 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  33.15 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  34.38 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  33.33 
 
 		 379 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  35.35 
 
 		 364 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  34.06 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  33.24 
 
 		 361 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  34.54 
 
 		 398 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  34.18 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  37.99 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  39.49 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  35.88 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  35.88 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  35.03 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  34.81 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  34.75 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  34.77 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  31.14 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  32.02 
 
 		 452 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  34.84 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  34.44 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  26.17 
 
 		 379 aa  149  7e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  34.57 
 
 		 375 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.15 
 
 		 370 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  31.6 
 
 		 547 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  32.41 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  30.57 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  31.15 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  29.68 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  33.22 
 
 		 365 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  37.98 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  34.09 
 
 		 369 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.07 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  29.06 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  28.29 
 
 		 356 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.74 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  25.58 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.95 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.84 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  28.05 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1589  protein of unknown function UPF0118  27.33 
 
 		 355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  28.65 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.92 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.18 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  30.65 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  27.22 
 
 		 363 aa  116  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  27.17 
 
 		 348 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  28.09 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  27.7 
 
 		 368 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.92 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.91 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.6 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.6 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.6 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.6 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.6 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  28.82 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  28.82 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  28.82 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  28.82 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>