More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3199 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  684    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  54.44 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  35.8 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  32.43 
 
 		 343 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  33.54 
 
 		 345 aa  192  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  32.82 
 
 		 341 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  35 
 
 		 344 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  32.11 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  31.58 
 
 		 361 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  31.87 
 
 		 348 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  31.87 
 
 		 361 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  31.87 
 
 		 361 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  31.87 
 
 		 361 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  31.58 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  31.58 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  31.58 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  31.14 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  31.29 
 
 		 361 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  32.1 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  31.29 
 
 		 361 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  30.23 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.71 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  31.29 
 
 		 357 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  31.79 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  30.62 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  30.62 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  30.62 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  30.62 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  30.62 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  29.32 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  29.32 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.3 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  29.41 
 
 		 355 aa  149  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.26 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  27.73 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  31.32 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  28.04 
 
 		 372 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  31.03 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  31.67 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  30.75 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  30.72 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  31.03 
 
 		 373 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  29.28 
 
 		 377 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  30.88 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  30.89 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  30.89 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  30.46 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  30.46 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  30.46 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  30.46 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.69 
 
 		 370 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  30.92 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  30.17 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  30.62 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  29.58 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.55 
 
 		 363 aa  135  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  28.21 
 
 		 382 aa  135  9e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  30.29 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  25.93 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.65 
 
 		 402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.65 
 
 		 402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  30.07 
 
 		 352 aa  133  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  26.12 
 
 		 357 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  27.73 
 
 		 378 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  25.85 
 
 		 357 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  29.65 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  26.69 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  26.32 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  26.15 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  26.13 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  27.04 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.87 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  25.85 
 
 		 360 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.79 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  27.19 
 
 		 374 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  25.86 
 
 		 379 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.86 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  27.92 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.54 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.16 
 
 		 388 aa  123  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  26.32 
 
 		 363 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  26.98 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.47 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  27.47 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  25.77 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  27.42 
 
 		 415 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  27.3 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  25.29 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  27.55 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  26.74 
 
 		 361 aa  116  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  26.74 
 
 		 361 aa  116  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  24.68 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  30.67 
 
 		 434 aa  116  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.46 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  27.46 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  26.44 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  26.44 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.02 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  27.5 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>