More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1428 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1091    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  51.51 
 
 		 369 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  45.48 
 
 		 374 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  44.57 
 
 		 378 aa  296  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  45.97 
 
 		 380 aa  289  7e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  46.88 
 
 		 365 aa  289  8e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  47.24 
 
 		 375 aa  289  9e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  47.24 
 
 		 358 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  46.02 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  48.77 
 
 		 357 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  44.9 
 
 		 370 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  45.51 
 
 		 374 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  44.9 
 
 		 370 aa  277  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  43.71 
 
 		 379 aa  277  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  44.54 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  44.18 
 
 		 370 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  44.73 
 
 		 374 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  42.55 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  42.9 
 
 		 361 aa  267  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  41.78 
 
 		 382 aa  265  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  44.79 
 
 		 364 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  41.51 
 
 		 382 aa  262  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  42.7 
 
 		 418 aa  261  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  41.83 
 
 		 382 aa  258  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  46.31 
 
 		 375 aa  256  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  44.24 
 
 		 363 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  45.78 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  40.75 
 
 		 434 aa  247  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  41.14 
 
 		 404 aa  243  5e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  45.23 
 
 		 382 aa  243  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  42.43 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  38.53 
 
 		 363 aa  236  9e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  43.02 
 
 		 357 aa  233  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  43.31 
 
 		 357 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  42.73 
 
 		 357 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  43.15 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  43.15 
 
 		 354 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  43.27 
 
 		 357 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  43.6 
 
 		 357 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  42.61 
 
 		 360 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  41.57 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  41.57 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  34.09 
 
 		 665 aa  205  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  39.84 
 
 		 389 aa  205  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  38.42 
 
 		 356 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  40 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  44.48 
 
 		 368 aa  195  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  30.92 
 
 		 379 aa  193  8e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  38.26 
 
 		 356 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  37.69 
 
 		 356 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  40.86 
 
 		 364 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  36.8 
 
 		 356 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  38.7 
 
 		 353 aa  192  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  35.38 
 
 		 368 aa  189  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  36.47 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  34.41 
 
 		 367 aa  186  9e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  34.01 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  33.53 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  38.92 
 
 		 385 aa  181  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  33.81 
 
 		 358 aa  181  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  34.53 
 
 		 329 aa  180  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  35.12 
 
 		 370 aa  179  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  32.24 
 
 		 354 aa  179  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  35.22 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  32.04 
 
 		 343 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  35.28 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  29.39 
 
 		 373 aa  176  8e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  33.93 
 
 		 368 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  38.64 
 
 		 385 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  35.33 
 
 		 358 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5310  hypothetical protein  46.15 
 
 		 162 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  hitchhiker  0.00163358 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  33.03 
 
 		 327 aa  166  1.0000000000000001e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  42.98 
 
 		 368 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  32.72 
 
 		 344 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0376  hypothetical protein  48.99 
 
 		 170 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0858  hypothetical protein  48.99 
 
 		 170 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159629  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0829  hypothetical protein  48.99 
 
 		 170 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000209543  hitchhiker  0.0000111881 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6223  hypothetical protein  48.72 
 
 		 162 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  29.31 
 
 		 351 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0748  hypothetical protein  47.02 
 
 		 169 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042872 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5723  hypothetical protein  49.36 
 
 		 179 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0731  hypothetical protein  45.7 
 
 		 169 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  37.57 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  33.63 
 
 		 329 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2530  hypothetical protein  45.03 
 
 		 169 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0293088 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  31.3 
 
 		 341 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  29.28 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3947  hypothetical protein  44.37 
 
 		 171 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0812209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  33.51 
 
 		 345 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  29.9 
 
 		 351 aa  145  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  30.18 
 
 		 371 aa  143  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34770  hypothetical protein  47.02 
 
 		 165 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  27.35 
 
 		 393 aa  141  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.22 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  30.6 
 
 		 356 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  28.62 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.08 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  28.49 
 
 		 369 aa  137  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  29.17 
 
 		 355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  29.17 
 
 		 355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>