21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6223 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6223  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  328  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5723  hypothetical protein  92.59 
 
 
179 aa  308  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630868  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5310  hypothetical protein  67.08 
 
 
162 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  hitchhiker  0.00163358 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0748  hypothetical protein  61.33 
 
 
169 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.042872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0731  hypothetical protein  60.67 
 
 
169 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2530  hypothetical protein  59.33 
 
 
169 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0293088 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0829  hypothetical protein  61.07 
 
 
170 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000209543  hitchhiker  0.0000111881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3947  hypothetical protein  59.33 
 
 
171 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0812209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0376  hypothetical protein  60.4 
 
 
170 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0858  hypothetical protein  60.4 
 
 
170 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159629  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  48.72 
 
 
547 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34770  hypothetical protein  51.97 
 
 
165 aa  152  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2074  hypothetical protein  46.1 
 
 
339 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1450  hypothetical protein  36.24 
 
 
148 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00351642  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1229  hypothetical protein  36.24 
 
 
217 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323968  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1252  cyclase/dehydrase  35.57 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000133913  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1716  hypothetical protein  35.33 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295351  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2547  hypothetical protein  33.97 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3474  hypothetical protein  34.57 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1159  hypothetical protein  36.17 
 
 
95 aa  47.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3525  hypothetical protein  29.61 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>