24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1252 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1252  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 148 aa  307  2e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000133913  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1229  hypothetical protein  85.81 
 
 		 217 aa  274  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323968  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1450  hypothetical protein  81.76 
 
 		 148 aa  256  1e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00351642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5723  hypothetical protein  35.57 
 
 		 179 aa  99.4  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630868  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6223  hypothetical protein  35.57 
 
 		 162 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2530  hypothetical protein  32.89 
 
 		 169 aa  94  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0293088 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3947  hypothetical protein  32.21 
 
 		 171 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0812209 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0748  hypothetical protein  31.54 
 
 		 169 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0731  hypothetical protein  31.54 
 
 		 169 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0829  hypothetical protein  32.89 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000209543  hitchhiker  0.0000111881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0376  hypothetical protein  32.89 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0858  hypothetical protein  32.89 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34770  hypothetical protein  34.69 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5310  hypothetical protein  32.17 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  hitchhiker  0.00163358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2074  hypothetical protein  28.19 
 
 		 339 aa  73.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1716  hypothetical protein  34.87 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  33.11 
 
 		 547 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3525  hypothetical protein  28.08 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2547  hypothetical protein  27.21 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2228  hypothetical protein  25.29 
 
 		 199 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0596  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 138 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  26.72 
 
 		 1011 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  26.72 
 
 		 1011 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1159  hypothetical protein  36.36 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>