21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0376 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0376  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  341  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0858  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  341  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159629  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0829  hypothetical protein  98.24 
 
 		 170 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000209543  hitchhiker  0.0000111881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3947  hypothetical protein  88.3 
 
 		 171 aa  298  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0812209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2530  hypothetical protein  89.57 
 
 		 169 aa  288  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0293088 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0748  hypothetical protein  84.71 
 
 		 169 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0731  hypothetical protein  83.53 
 
 		 169 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5310  hypothetical protein  62.16 
 
 		 162 aa  190  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  hitchhiker  0.00163358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5723  hypothetical protein  60.81 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630868  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6223  hypothetical protein  60.4 
 
 		 162 aa  175  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  48.99 
 
 		 547 aa  161  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34770  hypothetical protein  53.02 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2074  hypothetical protein  43.14 
 
 		 339 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1252  cyclase/dehydrase  32.89 
 
 		 148 aa  85.5  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000133913  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1450  hypothetical protein  30.87 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00351642  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1229  hypothetical protein  30.2 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323968  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1716  hypothetical protein  33.55 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2547  hypothetical protein  31.85 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3525  hypothetical protein  30.2 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3474  hypothetical protein  29.87 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1159  hypothetical protein  44.9 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>