20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3525 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3525  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  295  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0376  hypothetical protein  30.2 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0858  hypothetical protein  30.2 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159629  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1716  hypothetical protein  32.45 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0829  hypothetical protein  29.53 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000209543  hitchhiker  0.0000111881 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20260  polyketide cyclase / dehydrase family protein  40.22 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34770  hypothetical protein  34.25 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1252  cyclase/dehydrase  28.08 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000133913  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1229  hypothetical protein  29.45 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323968  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1450  hypothetical protein  26.03 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00351642  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  30.34 
 
 		 547 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3947  hypothetical protein  27.81 
 
 		 171 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0812209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0731  hypothetical protein  27.81 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0748  hypothetical protein  27.81 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2530  hypothetical protein  27.81 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0293088 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5723  hypothetical protein  30.26 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630868  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5310  hypothetical protein  26.49 
 
 		 162 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  hitchhiker  0.00163358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2074  hypothetical protein  27.78 
 
 		 339 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6223  hypothetical protein  29.61 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2487  Polyketide cyclase/dehydrase  30.36 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.519045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>