19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2487 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2487  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 		 139 aa  276  5e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1409  cyclase/dehydrase  43.17 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2654  cyclase/dehydrase  41.3 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1738  cyclase/dehydrase  35.25 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.265595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  30.95 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  23.76 
 
 		 205 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  22.62 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  27.5 
 
 		 239 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  23.66 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  23.96 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  23.66 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  22.58 
 
 		 159 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  24.53 
 
 		 155 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  23.3 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  27.21 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  20.51 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3525  hypothetical protein  30.36 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  23.08 
 
 		 155 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>