92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0007 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  100 
 
 
160 aa  330  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  60 
 
 
162 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  60 
 
 
181 aa  197  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  56.13 
 
 
205 aa  194  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  58.78 
 
 
156 aa  190  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  57.05 
 
 
153 aa  188  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  55.03 
 
 
153 aa  186  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  57.43 
 
 
232 aa  185  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  55.13 
 
 
156 aa  185  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  55.56 
 
 
272 aa  183  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  54.73 
 
 
170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  54.73 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  54.05 
 
 
159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  55.03 
 
 
328 aa  178  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  54.79 
 
 
203 aa  178  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  52.35 
 
 
152 aa  174  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  52.9 
 
 
155 aa  173  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  52.05 
 
 
300 aa  171  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  51.68 
 
 
210 aa  171  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  49.68 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  51.05 
 
 
287 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  46.41 
 
 
337 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  48.15 
 
 
143 aa  150  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1093  cyclase/dehydrase  44.87 
 
 
212 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  45.75 
 
 
216 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  47.3 
 
 
155 aa  147  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0245  cyclase/dehydrase  38.61 
 
 
217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4005  cyclase/dehydrase  41.5 
 
 
330 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  41.48 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3381  cyclase/dehydrase  40.6 
 
 
416 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155742  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2374  cyclase/dehydrase  38.81 
 
 
336 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361241  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2333  cyclase/dehydrase  38.35 
 
 
335 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2380  cyclase/dehydrase  38.35 
 
 
335 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2352  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 
418 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.196534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6854  integral membrane protein-like protein  34.44 
 
 
394 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14140  polyketide cyclase / dehydrase family protein  34.78 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.850996 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  37.32 
 
 
225 aa  85.5  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 
243 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  36.84 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  32.41 
 
 
244 aa  74.7  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2654  cyclase/dehydrase  30.97 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  30.38 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  32.21 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 
269 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  28.79 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  29.5 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  29.53 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  30.52 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  26.47 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  31.43 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  32.64 
 
 
239 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  25.9 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  30.82 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  34.27 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 
241 aa  67.4  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  31.21 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  30.5 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 
244 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  34.33 
 
 
240 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  27.61 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 
238 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  31.72 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  31.79 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0978  cyclase/dehydrase  28.06 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  28.24 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  32.17 
 
 
256 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01301  putative integral membrane protein  26.09 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.561031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  29.01 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37514  predicted protein  31.21 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.458024 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01311  putative integral membrane protein  25.19 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  32.59 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0117  putative integral membrane protein  26.67 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01321  putative integral membrane protein  25.19 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0994  cyclase/dehydrase  26.62 
 
 
164 aa  57.4  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  29.55 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  29.55 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0199  cyclase/dehydrase  28.24 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0336  hypothetical protein  26.87 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01281  putative integral membrane protein  24.44 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.49008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3955  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.038977  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  27.03 
 
 
212 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  27.7 
 
 
212 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  27.03 
 
 
214 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0167  cyclase/dehydrase  32.47 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22431  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1409  cyclase/dehydrase  24.22 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  29.58 
 
 
223 aa  48.5  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1322  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 
237 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1738  cyclase/dehydrase  28.21 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.265595 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2487  Polyketide cyclase/dehydrase  22.62 
 
 
139 aa  44.3  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.519045  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43619  predicted protein  29.73 
 
 
241 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>