80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4854 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 155 aa  313  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  69.74 
 
 		 158 aa  225  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  71.81 
 
 		 152 aa  223  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  70.39 
 
 		 203 aa  220  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  65.58 
 
 		 205 aa  211  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  63.82 
 
 		 153 aa  202  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  61.74 
 
 		 287 aa  201  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  60 
 
 		 328 aa  200  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  61.84 
 
 		 153 aa  192  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  59.21 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  59.73 
 
 		 162 aa  186  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  59.48 
 
 		 232 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  61.74 
 
 		 155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  55.7 
 
 		 210 aa  178  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  52.9 
 
 		 160 aa  173  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1093  cyclase/dehydrase  53.42 
 
 		 212 aa  165  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  51.35 
 
 		 181 aa  159  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  50 
 
 		 170 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  49.35 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  52.05 
 
 		 272 aa  156  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  48.7 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  47.65 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  49.32 
 
 		 300 aa  148  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  45.21 
 
 		 337 aa  140  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  48.53 
 
 		 143 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0245  cyclase/dehydrase  41.61 
 
 		 217 aa  135  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4005  cyclase/dehydrase  42.18 
 
 		 330 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  43.54 
 
 		 216 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  40.56 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  33.56 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2352  cyclase/dehydrase  34.64 
 
 		 418 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.196534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6854  integral membrane protein-like protein  33.11 
 
 		 394 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3381  cyclase/dehydrase  33.11 
 
 		 416 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2333  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 335 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2380  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 335 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2374  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 336 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361241  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14140  polyketide cyclase / dehydrase family protein  35.57 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.850996 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  31.88 
 
 		 225 aa  77  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  30.5 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  31.65 
 
 		 303 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  32.21 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  29.29 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  31.43 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  34.03 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  29.53 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  30.2 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  29.86 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  29.08 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  31.43 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  31.43 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 		 239 aa  60.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  29.29 
 
 		 244 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  24.06 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  27.11 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  29.08 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01301  putative integral membrane protein  26.62 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.561031 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  27.14 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  24.82 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  24.29 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  27.46 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0117  putative integral membrane protein  26.47 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  27.86 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01321  putative integral membrane protein  25.53 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  24.44 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  28.77 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37514  predicted protein  28.78 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.458024 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01311  putative integral membrane protein  25.74 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  24.46 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1409  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0167  cyclase/dehydrase  30.77 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01281  putative integral membrane protein  23.53 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.49008  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0336  hypothetical protein  25.62 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  25.9 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  25.18 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1322  cyclase/dehydrase  26.12 
 
 		 237 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2654  cyclase/dehydrase  24.14 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0994  cyclase/dehydrase  24.82 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1310  cyclase/dehydrase  26.32 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48096  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  24.44 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>