72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0336 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0336  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  297  3e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  86.01 
 
 		 145 aa  246  9e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  75.52 
 
 		 149 aa  225  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01301  putative integral membrane protein  60.14 
 
 		 157 aa  193  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.561031 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  64.63 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  62.59 
 
 		 150 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01311  putative integral membrane protein  56.46 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01321  putative integral membrane protein  56.46 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01281  putative integral membrane protein  57.14 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.49008  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0117  putative integral membrane protein  53.06 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  51.75 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  47.14 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0199  cyclase/dehydrase  46.43 
 
 		 151 aa  143  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  47.18 
 
 		 149 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  47.18 
 
 		 149 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  47.14 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  47.48 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3955  cyclase/dehydrase  46.48 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.038977  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37514  predicted protein  33.11 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.458024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  28.36 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11048  predicted protein  32.14 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  32.67 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43619  predicted protein  28.89 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  28.24 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  27.42 
 
 		 337 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  26.87 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  25.76 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  26.87 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  28.06 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  27.48 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  26.87 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  27.48 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 241 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  26.87 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  29.55 
 
 		 223 aa  53.9  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  29.1 
 
 		 210 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  26.12 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  26.72 
 
 		 216 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  28.06 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  24.39 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  26.09 
 
 		 232 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 		 303 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 232 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  23.14 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  27.01 
 
 		 287 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  26.95 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  25.62 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  23.39 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  26.28 
 
 		 328 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  27.69 
 
 		 240 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  25.55 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3371  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 		 409 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  23.85 
 
 		 256 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4005  cyclase/dehydrase  29.07 
 
 		 330 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  26.72 
 
 		 244 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  24.46 
 
 		 244 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  25.35 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2346  Polyketide cyclase/dehydrase  26.97 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6854  integral membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 394 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  23.88 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  24.46 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  25.83 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4987  hypothetical protein  24.29 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  25.68 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  25.93 
 
 		 231 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  22.39 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3381  cyclase/dehydrase  34.41 
 
 		 416 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  23.7 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  24.62 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  22.79 
 
 		 145 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>