65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1322 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1322  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 237 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  36.65 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  40.28 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  39.81 
 
 		 239 aa  148  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  35.06 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  39.53 
 
 		 225 aa  132  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  34.6 
 
 		 242 aa  128  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  31.8 
 
 		 284 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  31.88 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  37.29 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  36.19 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  29.1 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  29.26 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  31.1 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  33.81 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  34.03 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 187 aa  95.5  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  29.8 
 
 		 162 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0167  cyclase/dehydrase  35.57 
 
 		 169 aa  92.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  31.58 
 
 		 164 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  28.77 
 
 		 162 aa  89  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0994  cyclase/dehydrase  29.8 
 
 		 164 aa  86.3  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  31.39 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  32.68 
 
 		 212 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0978  cyclase/dehydrase  25.69 
 
 		 151 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  32.68 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  31.21 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  30.07 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3397  Polyketide cyclase/dehydrase  26.34 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  26.39 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1310  cyclase/dehydrase  26.87 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48096  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  29.85 
 
 		 145 aa  52.4  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3955  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.038977  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 151 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  28.26 
 
 		 159 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  27.34 
 
 		 328 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  23.88 
 
 		 158 aa  48.5  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  25.53 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  32.88 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  23.49 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  32.88 
 
 		 170 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 160 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  26.12 
 
 		 148 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6854  integral membrane protein-like protein  29.36 
 
 		 394 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  27.89 
 
 		 149 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  27.89 
 
 		 149 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  26.12 
 
 		 155 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  25.69 
 
 		 147 aa  45.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0117  putative integral membrane protein  23.94 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3381  cyclase/dehydrase  35.45 
 
 		 416 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  23.88 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  22.97 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  24.11 
 
 		 337 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2333  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 		 335 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  26.72 
 
 		 152 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  25.35 
 
 		 150 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01311  putative integral membrane protein  23.94 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2374  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 		 336 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361241  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  24.31 
 
 		 145 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2380  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 		 335 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01321  putative integral membrane protein  23.24 
 
 		 156 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  24.82 
 
 		 150 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3371  cyclase/dehydrase  23.32 
 
 		 409 aa  42.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>