59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3381 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3381  cyclase/dehydrase  100 
 
 
416 aa  823    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155742  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6854  integral membrane protein-like protein  62.67 
 
 
394 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2374  cyclase/dehydrase  51.32 
 
 
336 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361241  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2333  cyclase/dehydrase  52.54 
 
 
335 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2380  cyclase/dehydrase  52.54 
 
 
335 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4005  cyclase/dehydrase  43.79 
 
 
330 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2352  cyclase/dehydrase  42.95 
 
 
418 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.196534 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  40.91 
 
 
162 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  39.85 
 
 
203 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  40.24 
 
 
170 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  43.33 
 
 
159 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  42 
 
 
159 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  38.64 
 
 
153 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  38.41 
 
 
232 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  36.77 
 
 
152 aa  109  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  39.39 
 
 
216 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  39.53 
 
 
300 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  40.6 
 
 
160 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  34.62 
 
 
328 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  41.5 
 
 
156 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  32.82 
 
 
210 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  35.34 
 
 
287 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  37.21 
 
 
337 aa  102  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  36.84 
 
 
158 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  35.34 
 
 
155 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  37.12 
 
 
153 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  39.69 
 
 
272 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  34.87 
 
 
156 aa  97.1  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  36.76 
 
 
205 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  36.88 
 
 
181 aa  93.2  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  38.35 
 
 
155 aa  92.8  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
143 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1093  cyclase/dehydrase  31.77 
 
 
212 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0245  cyclase/dehydrase  29.53 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  41 
 
 
158 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  28.36 
 
 
145 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  35.45 
 
 
225 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  34.34 
 
 
197 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14140  polyketide cyclase / dehydrase family protein  33.66 
 
 
164 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.850996 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  30.63 
 
 
244 aa  57.4  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  30.77 
 
 
217 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  31.82 
 
 
242 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  29.63 
 
 
269 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  30.09 
 
 
232 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  29.63 
 
 
284 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  34.33 
 
 
212 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  30.91 
 
 
243 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  33.58 
 
 
212 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  30.15 
 
 
214 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  29.46 
 
 
231 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  24.36 
 
 
239 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 
187 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  26.09 
 
 
240 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  24.48 
 
 
238 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  24 
 
 
303 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  32.38 
 
 
219 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  27.12 
 
 
256 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  26.79 
 
 
241 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1322  cyclase/dehydrase  34.45 
 
 
237 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>